Forskningsassistent inom AI för prostatacancerdiagnostik, timanställning

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?
Institutionen för medicinsk epidemiologi och biostatistik bedriver forskning inom epidemiologi och biostatistik inom ett brett spektrum av områden inom biomedicinsk vetenskap. Institutionen är bland de största inom sitt område i Europa och har särskilt starka forskningsprofiler inom psykiatrisk, cancer-, reproduktiv, pediatrisk, farmakologisk, genetisk och geriatrisk epidemiologi, ätstörningar, precisionsmedicin, och biostatistik.

En del av framgången för institutionen beror på vår samarbetsanda, där en stor bidragande faktor är att forskare vid institutionen delar och samfinansierar gemensamma resurser (som t.ex. IT och en tillämpad biostatistikgrupp). Institutionen ligger på campus Solna. Mer information finns på http://ki.se/meb.

Forskargruppen är knuten till det nationella programmet Data Driven Life Sciences (DDLS) och SciLifeLab (https://www.scilifelab.se/researchers/kimmo-kartasalo/). Vi bedriver internationell spjutspetsforskning inom beräkningspatologi och artificiell intelligens (AI) och har under flera år utvecklat AI-modeller som hjälper patologer att bedöma prostatabiopsier. Nu utvidgar vi vår AI-analys till att även omfatta radiologiska bilder och söker en forskningsassistent som kan stödja detta arbete. Vi tror på nära handledning där varje teammedlem tar ett tydligt ansvar för sitt arbete, och tjänsten ger goda möjligheter till fördjupning, till exempel genom ett examensarbete.
Din roll
Projektet syftar till att föra AI för prostatacancerdiagnostik ett steg närmare klinisk användning. Fokus ligger på att bygga upp kompetens inom AI-baserad analys av radiologiska bilddata, samt att bistå i pågående projekt inom beräkningspatologi. Som forskningsassistent bidrar du till detta arbete vid sidan av dina studier, i nära samarbete med forskare inom datavetenskap, statistik och medicin.

Dina arbetsuppgifter kommer att omfatta:

Digitalisering av objektglas från prostatabiopsier med WSI-skannrar samt kvalitetskontroll av de resulterande WSI-bilderna.

Utveckling och underhåll av Python-baserade pipelines för bearbetning och analys av medicinska bilddata, såsom WSI-bilder och MR-bilder.

Medverkan i utvärderingen av AI-modeller för prostatacancerdiagnostik.

Dokumentation och rapportering av resultat till forskargruppen.

Detta är en timanställning med flexibla arbetstider, motsvarande cirka 20% av heltid.
Vem är du?
Den sökande förväntas ha följande kunskaper och erfarenheter:

• Avslutad kandidatexamen inom artificiell intelligens, data science, biostatistik, datavetenskap, matematik, medicinsk bildanalys eller närliggande område.
• Praktisk erfarenhet av att digitalisera histopatologiska objektglas till digitala bilder (whole slide images, WSI) med en WSI-skanner.
• Tidigare erfarenhet av att arbeta med MR-data.
• Erfarenhet av att utveckla djupinlärningsmodeller, t.ex. transformerbaserade modeller, för medicinska data.
• Erfarenhet av att utveckla och optimera Python-baserade pipelines för analys av kliniska data.
• Erfarenhet av att utforma utvärderingsstrategier för AI-system.
• Förmåga att arbeta väl både självständigt och tillsammans med andra.
• Utmärkt kommunikativ förmåga på engelska i tal och skrift.

Följande kunskaper och erfarenheter är meriterande:

• Erfarenhet av statistisk modellering eller biostatistik, t.ex. överlevnadsanalys.
• Forskningserfarenhet från en cancerforskningsmiljö.
• Erfarenhet av multimodala modeller som kombinerar olika typer av kliniska data.
• Internationell och tvärvetenskaplig forskningserfarenhet.
• Intresse för robusthet, osäkerhet och validering av AI-modeller för klinisk användning.
• Övriga kunskaper inom biomedicin, digital patologi eller datavetenskap är en fördel.

Vi lägger stor vikt vid personliga egenskaper i denna rekrytering. Som person är du nyfiken, proaktiv, ansvarstagande och samarbetsinriktad.
Vad erbjuder vi?
En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.

Placering: Solna

Tio skäl att välja Karolinska Institutet

Ansökan
KI tillämpar individuell och differentierad lönesättning enligt våra kollektivavtal RALS och RALS-T.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet.
Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss