PhD Position in Glioblastoma Immunology

Är du driven av en vilja att bidra till banbrytande medicinsk forskning?
Sten Linnarssons grupp, är en del av Enheten för molekylär neurobiologi vid Institutionen för medicinsk biokemi och biofysik (MBB), utlyser en doktorandtjänst. Vår forskargrupp har ett världsledande rykte inom banbrytande studier av hjärnans utveckling med hjälp av avancerade singelcellsteknologier. Vi fokuserar nu på att kartlägga biologin bakom glioblastom (GBM), den mest aggressiva hjärntumören, för att identifiera nya behandlingsmål.
Forskargruppen
Vår forskning fokuserar på hjärnans cellulära sammansättning, både i frisk hjärnvävnad och vid hjärntumörer. Vi använder singelcellsanalyser för att identifiera celltyper, celltillstånd och cellinjer i den friska människohjärnan. Med hjälp av dessa molekylära atlaser kartlägger vi celler från hjärntumörer i syfte att identifiera unika celltillstånd som kan vara mål för behandling.

För att uppnå dessa mål har vi utvecklat tekniker för mycket känslig och exakt detektion av RNA och DNA i enskilda celler. Vi använder avancerad molekylärbiologi, storskalig DNA-sekvensering, mikrofluidik och avbildning. Vi använder även AI/ML för att modellera molekylära tillstånd och utvecklar syntetiska vektorer för att rikta och manipulera celltillstånd in vivo. Vår långsiktiga ambition är att utveckla effektiva, programmerbara terapier mot hjärncancer.
Doktorandprojektet och arbetsuppgifter
Detta doktorandprojekt syftar till att undersöka immundysfunktion vid glioblastom (GBM) och utveckla nya immunterapeutiska strategier. Trots framsteg inom cancerimmunterapi är GBM i stor utsträckning motståndskraftigt mot immunbaserade behandlingar, främst på grund av en starkt immunsuppressiv tumörmikromiljö som försämrar antigenpresentationen och begränsar effektiva T-cellsvar, där tumörinfiltrerande T-celler uppvisar ett dysfunktionellt beteende.

Det första målet är att karakterisera fenotyper hos infiltrerande T-celler och undersöka hur deras funktionella tillstånd påverkas av den lokala mikromiljön. För att studera det rumsliga immunlandskapet och T-cellsklonernas dynamik i GBM kommer singelcellstranskriptomik och TCR-sekvensering att utföras och analyseras med hjälp av patientprover från hjärnan. Baserat på dessa resultat kommer kandidaten att utvärdera en tumör-omprogrammeringsstrategi som syftar till att återställa antigenpresentation och stärka anti-tumöreffektiva T-cellsvar.

För detta ändamål kommer doktoranden att etablera en humaniserad ortotopisk GBM-musmodell med hjälp av CD34⁺ hematopoetisk stamcellsinplantation och patienthärledda tumöroidorganoider för att studera tumör-immuninteraktioner och bedöma potentiell terapeutisk effekt in vivo.

Doktoranden kommer att arbeta med ett brett spektrum av experimentella metoder, inklusive isolering och bearbetning av human- och musvävnad, avancerad multiparametrisk flödescytometri, in vitro-funktionella analyser såsom kokulturer och cytotoxicitetsanalyser samt in vivo-arbete med musmodeller.
Vad erbjuder vi?
Du kommer att arbeta i en dynamisk och kreativ miljö där tvärvetenskapligt samarbete uppmuntras. Vår forskargrupp erbjuder tillgång till toppmoderna tekniker och resurser, vilket ger en idealisk plattform för att driva forskningen inom glioblastom-immunologi framåt. Du kommer att arbeta nära experter inom området och få tillgång till handledning och beräkningsstöd för att genomföra forskningsprojekt av hög kvalitet.

Som doktorand erbjuds du ett eget forskningsprojekt, kvalificerad handledning, ett brett utbud av valbara kurser samt möjlighet att arbeta i en ledande forskningsmiljö. Karolinska Institutet samarbetar med framstående universitet världen över, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Du kommer att vara anställd som doktorand med lön enligt avtal. Medarbetare har också tillgång till ett modernt gym utan kostnad samt ersättning för sjukvård.
Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå
För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande(A)och det särskilda(B)behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller

har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller

har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidanBehörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidanBedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

- Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidanEnglish language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas. Inlämnande av falska handlingar är ett brott mot svensk lag och anses vara grund för rättsliga åtgärder.
Färdigheter och personliga egenskaper
Vi söker en kreativ och självgående kandidat med ett starkt intresse för cancerimmunologi och hjärnbiologi, som trivs i tvärvetenskapliga team och har god kommunikativ förmåga.

Kvalifikationer:
Examen på masternivå inom relevant område (t.ex. biomedicin eller immunologi) är ett krav. Kandidaten ska ha gedigen praktisk laboratorieerfarenhet och kunna arbeta självständigt, med god organisationsförmåga och noggrannhet i datahantering. Hög motivation, kritiskt tänkande samt förmåga att planera och tolka experiment är nödvändigt.

En stark bakgrund inom tumörimmunologi och hjärntumörbiologi förväntas. Kunskap om singelcellstranskriptomik, GMP-miljöer eller läkemedelsutveckling är meriterande. Erfarenhet av in vivo-arbete och djurhantering är ett krav (FELASA-certifiering är meriterande), liksom kännedom om relevanta musmodeller.

Omfattande erfarenhet av cellisolering (från human- och musvävnad), däggdjurscellodling (särskilt T-celler och organoider) samt avancerade funktionella analyser krävs. Erfarenhet av genetisk modifiering, arbete med virala vektorer och högdimensionell flödescytometri inklusive dataanalys är viktig. Programmeringskunskaper (R/Python) är meriterande.
Villkor
Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.

Ansökan
Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla dessa dokument:

- Ett personligt brev och curriculum vitae
- Eventuella examensarbeten och publikationer
- Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper
- Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (seAovan)
- Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (seBovan)
Urval
Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

- Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
- Analytisk skicklighet
- Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning
I denna rekryteringsprocess kommer stor vikt att läggas vid personliga egenskaper, inklusive kandidatens förmåga att samarbeta, ta initiativ och bidra till en dynamisk forskningsmiljö.
Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.
Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet