Doktorandplats inom natural killer (NK) cell biologi.

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?
Att vara doktorand innebär att vara antagen till en utbildning på forskarnivå (forskarutbildning) där man följer en individuell studieplan. En doktorand ägnar sig åt ett forskningsprojekt under handledning, kompletterat med kurser och andra lärandeaktiviteter. För en doktorsexamen krävs motsvarande fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.

Institutionen för mikrobiologi, tumör- och cellbiologi (MTC) vid Karolinska Institutet bedriver forskning och undervisning inom immunologi, infektionsbiologi, cellbiologi och cancer. Våra nyckelord är multidisciplinära, överbryggande, nationella och internationella samarbeten.
Forskargruppen
Tjänsten är placerad vid den nyetablerade Centrum för immunonkologi vid Institutionen för mikrobiologi, tumör- och cellbiologi (MTC), Karolinska Institutet. Avdelningen samlar expertis inom grundläggande immunologi, cancerbiologi och cellulär immunterapi och erbjuder en dynamisk och tvärvetenskaplig forskningsmiljö med starka kopplingar till klinisk och translationell forskning.

Malmbergs forskargrupp har under lång tid bedrivit forskning om humana naturliga mördarceller (NK-celler) och utveckling av nästa generations NK-cellsbaserade immunterapier. Vår forskning kombinerar avancerade encellsanalyser och beräkningsbaserade metoder, genetisk modifiering, högupplöst mikroskopi och funktionella tumörmodeller för att förstå de molekylära mekanismer som styr NK-cellernas differentiering, cytotoxicitet och persistens.

Doktorandprojektet ingår i ett större forskningsprogram med målet att kartlägga och modifiera de intracellulära program som reglerar immuncellers funktion. Genom nära samarbeten med kliniska och translationella forskargrupper vid Karolinska Universitetssjukhuset och internationella samarbetspartner strävar vi efter att omsätta grundläggande forskningsupptäckter i innovativa cellulära immunterapier mot cancer.
Doktorandprojektet och doktorandens uppgifter
Naturliga mördarceller (NK-celler) är immunceller med en inneboende förmåga att känna igen och eliminera cancerceller. De är kandidater för nästa generations cancerimmunterapier. Detta doktorandprojekt syftar till att kartlägga och omprogrammera det cytotoxiska operativsystemet i humana NK-celler, med fokus på de regulatoriska nätverk som styr cellernas mognad, cytotoxiska funktion och persistens. Projektet kombinerar avancerade encellsanalyser, beräkningsbaserad modellering, genetisk modifiering och funktionella studier i primära NK celler och NK celler deriverade från inducerade pluripotenta stam celler (iPSC).

Projektet omfattar tre integrerade delar:

Kartläggning av det cytotoxiska operativsystemet genom att jämföra iPSC-deriverade NK-celler med naturligt förekommande, högfunktionella NK-cellspopulationer med hjälp av encellstranskriptomik, epigenetisk profilering och beräkningsbaserad analys av genregulatoriska nätverk.

Utveckling av förbättrade NK-cellstillstånd genom riktade genetiska modifieringar, inklusive CRISPR/Cas9-baserad genredigering och reglering av genuttryck, för att identifiera program som främjar mognad, cytotoxicitet och motståndskraft mot cellulär stress i tumörmiljö.

Validering av terapeutisk potential genom att utvärdera genetiskt modifierade NK-celler i avancerade funktionella analyser och prekliniska modeller av hematologiska maligniteter och solida tumörer, med särskilt fokus på persistens och långvarig antitumöreffekt.

Doktoranden kommer att:

• Arbeta med humana iPSC och utveckla genetiskt modifierade iPSC-NK-celler.
• Tillämpa CRISPR/Cas9-baserad genredigering, inklusive riktade genetiska modifieringar och funktionella screeningsstrategier.
• Utföra avancerad multiparametrisk flödescytometri och cellsortering.
• Genomföra funktionella cytotoxicitetsanalyser, inklusive högupplöst mikroskopi och analyser av serial killing.
• Generera och analysera transkriptomiska och epigenetiska data, inklusive encellsanalyser och beräkningsbaserad modellering av genregulatoriska nätverk.
• Undersöka NK-cellernas mognad, metabola kapacitet och funktionella motståndskraft under tumörrelaterade stressförhållanden.
• Delta i prekliniska studier som utvärderar NK-cellernas persistens och antitumöreffekt.
• Presentera forskningsresultat vid vetenskapliga möten och internationella konferenser, bidra till vetenskapliga publikationer samt genomföra obligatoriska kurser inom forskarutbildningen.

Doktoranden förväntas ta en aktiv roll i experimentell design, dataanalys, vetenskaplig tolkning och utveckling av nya forskningshypoteser. Projektet erbjuder en tvärvetenskaplig forskarutbildning i gränslandet mellan grundläggande immunologi, stamcellsbiologi, genetisk modifiering, beräkningsbiologi och translationell cancerimmunterapi.
Vad erbjuder vi?
En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Som doktorand erbjuds du ett individuellt forskningsprojekt, en välutbildad handledare, ett stort utbud av valbara kurser och möjligheten att arbeta i en framgångsrik forskargrupp. Karolinska Institutet har samarbeten med framstående universitet över hela världen, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Som anställd doktorand får du en avtalsenlig lön, du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och du får ersättning för läkarvård.
Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå
För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande (A) och det särskilda (B) behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller

har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller

har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidan Bedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

- Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidan English language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas. Inlämnande av falska handlingar är ett brott mot svensk lag och anses vara grund för rättsliga åtgärder.
Färdigheter och personliga egenskaper
Utöver ovan nämnda krav för rollen:

• Masterexamen inom immunologi, molekylärbiologi, biomedicin, bioteknik, bioinformatik, beräkningsbiologi eller närliggande område.
• Goda dokumenterade kunskaper inom molekylär- och cellbiologi, immunologi eller beräkningsbiologi.
• Erfarenhet av antingen experimentell molekylär- och cellbiologi eller beräkningsbaserad analys av biologiska data.
• God förståelse för kvantitativ dataanalys och vetenskaplig metodik.
• Mycket god förmåga att kommunicera i tal och skrift på engelska.
• God analytisk förmåga och problemlösningsförmåga, vetenskaplig nyfikenhet samt förmåga att arbeta både självständigt och i samarbete med andra i en tvärvetenskaplig forskningsmiljö.

Meriterande för rollen:

• Erfarenhet av encellstranskriptomik, multiomik och tillhörande dataanalys med verktyg såsom Seurat, Scanpy, scVI/MultiVI eller motsvarande.
• Erfarenhet av funktionell genomik och genetisk modifiering, inklusive CRISPR/Cas9-baserade screeningbibliotek, poolade genetiska perturbationsstudier eller Perturb-seq.
• Erfarenhet av programmering i Python och/eller R, inklusive statistisk analys, visualisering och bearbetning av biologiska data.
• Kunskap om maskininlärning, analys av genregulatoriska nätverk, trajektorieanalys eller beräkningsbaserad analys av celldifferentiering.
• Erfarenhet av molekylärbiologiska metoder, inklusive kloning, lentiviral genöverföring och analys av genuttryck.
• Erfarenhet av arbete med primära immunceller, humana cellinjer, stamcellsodling eller iPSC-differentiering.
• Praktisk erfarenhet av flödescytometri, cellsortering, avancerad mikroskopi eller funktionella cellbaserade analyser.

Villkor
Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.
Ansökan
Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla dessa dokument:

- Ett personligt brev och curriculum vitae
- Eventuella examensarbeten och publikationer
- Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper
- Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (se A ovan)
- Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (se B ovan)
Urval
Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

- Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
- Analytisk skicklighet
- Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning

Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.

KI tillämpar en lönestege vid lönesättning av doktorander.
Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet