Staff scientist inom kemisk lipidbiologi och strukturell interaktomik

Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 41 500 studenter och cirka 4 600 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå universitet är allt nära. Våra sammanhållna campus gör det lätt att mötas, samarbeta och utbyta kunskap, något som gynnar en dynamisk och öppen kultur.

Den samhällsomvandling och de stora gröna investeringar vi ser i norra Sverige skapar enorma möjligheter och komplexa utmaningar. För Umeå universitet handlar det om att bedriva forskning om - och mitt i - ett samhälle i omvandling. Men också om att leverera utbildningar för regioner som behöver expandera fort och hållbart. Det är helt enkelt här framtiden skapas.

Är du intresserad av att veta mer? Läs mer om Umeå universitet som arbetsplats.

Projektbeskrivning

Chorells forskargrupp söker en staff scientist till ett projekt som utvecklar rumsligt och tidsmässigt upplöst sfingolipidomik för att förstå mitokondriella lipid-proteininteraktioner vid insulinresistens. Projektet kombinerar mitokondrieriktade, ljusaktiverbara sfingolipidprekursorer och fotoaktiverbara, klickbara ceramid- och deoxyceramidprober med UV-aktivering, klickkemibaserad anrikning, målriktad lipidomik och högupplösande XL-MS/interaktomik. Arbetet genomförs i muskel- och adipocytmodeller och syftar till att koppla lipidflöde och bindningsytor till mitokondriell stress och nedsatt insulinkänslighet.

Anställningen är tidsbegränsad till 11 månader på heltid. Arbetet är placerat i Umeå och sker i nära samverkan med masspektrometri- och kemisk-biologi-miljöer inom Umeå universitet, Swedish Metabolomics Centre och SciLifeLab-relaterad infrastruktur.

Arbetsuppgifter

Du leder självständigt den experimentella och analytiska metodutvecklingen för projektets klickkemibaserade lipidinteraktomik. I arbetet ingår att planera och optimera UV-fotoaktivering, kovalent infångning av transienta lipid-proteinkontakter, alkin-azid-ligering, affinitetsanrikning med magnetkulor samt provberedning för högupplösande LC-MS/MS och XL-MS. Du utvecklar reproducerbara arbetsflöden, lämpliga negativa kontroller och kvantitativa strategier för att skilja specifika interaktioner från bakgrundssignaler.

Du genomför experiment i etablerade muskel- och adipocytmodeller och integrerar interaktomik med målriktad lipidomik och puls-chase-baserade flödesmätningar. Du ansvarar för kvalitetskontroll, dataanalys och strukturell tolkning av protein-lipidaddukter och kandidatbindningsytor, samt prioriterar interaktionsnoder för funktionell validering. Arbetet omfattar också vetenskaplig dokumentation, protokollutveckling, FAIR datahantering, manusarbete, presentation av resultat och kunskapsöverföring inom forskargruppen och till samarbetspartner. Vissa gemensamma administrativa uppgifter kan ingå.

Kompetenskrav

Vi söker dig som har:

• doktorsexamen inom proteomik, analytisk kemi, biokemi, kemisk biologi, strukturbiologi, klinisk farmakologi eller ett närliggande område;

• dokumenterad praktisk erfarenhet av masspektrometrisk metodutveckling och dataanalys som omfattar både protein-/peptidanalys och kvantitativ LC-MS/MS av små molekyler i biologiska eller kliniska prov;

• dokumenterad erfarenhet av crosslinking-masspektrometri (XL-MS), strukturell proteomik eller en metodik som är direkt jämförbar med dessa;

• förmåga att självständigt planera, felsöka, kvalitetssäkra och dokumentera komplexa experimentella arbetsflöden;

• mycket god förmåga att kommunicera vetenskap på engelska i tal och skrift.

Meriterande kompetens

Det är särskilt meriterande om du har erfarenhet av ett eller flera av följande områden:

• fotoaffinitetsmärkning, klickkemi, UV-korsbindning eller affinitetsanrikning av proteinaddukter;

• lipidomik eller sfingolipidomik, inklusive målriktad analys med trippelkvadrupol och/eller högupplösande analys med Orbitrap/Q-Exactive;

• utveckling och validering av robusta LC-MS/MS-metoder för kliniska prov eller farmakokinetiska studier;

• molekylärdynamiska simuleringar, strukturinformerad dataanalys eller identifiering av proteiners bindningsytor;

• cellodling och experimentella modeller för skelettmuskel, adipocyter, insulinresistens eller typ 2-diabetes;

• integrering av proteomik-, lipidomik- och interaktomikdata med R, Python eller motsvarande verktyg;

• handledning, metodutbildning, internationellt samarbete och reproducerbara arbetssätt inom öppen vetenskap.

Personliga egenskaper och språk

Projektet kräver att du arbetar strukturerat och noggrant, tar vetenskapligt ansvar och kan driva metodutveckling från optimering till biologisk tolkning. Du behöver vara lösningsorienterad och trivas i ett tvärvetenskapligt samarbete mellan kemisk biologi, proteomik, lipidomik och metabol fysiologi. Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet och dokumenterad förmåga att bidra till en inkluderande forskningsmiljö. Arbetsspråket i projektet är huvudsakligen engelska.

Ansökan

Ansökan ska innehålla CV, personligt brev med en tydlig beskrivning av hur din erfarenhet motsvarar kompetenskraven, examensbevis för doktorsexamen samt publikationslista. Ansökan ska vara inkommen senast 2026-10-01.

Varmt välkommen med din ansökan!

Umeå universitet vill erbjuda en jämställd och jämlik miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och erfarenheter att söka den aktuella anställningen.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.