Forskningsingenjör i beräkningspatologi

Institutionen för medicinsk epidemiologi och biostatistik bedriver forskning inom epidemiologi och biostatistik inom ett brett spektrum av områden inom biomedicinsk vetenskap. Institutionen är bland de största inom sitt område i Europa och har särskilt starka forskningsprofiler inom psykiatrisk, cancer-, reproduktiv, pediatrisk, farmakologisk, genetisk och geriatrisk epidemiologi, ätstörningar, precisionsmedicin, och biostatistik.

En del av framgången för institutionen beror på vår samarbetsanda, där en stor bidragande faktor är att forskare vid institutionen delar och samfinansierar gemensamma resurser (som t.ex. IT och en tillämpad biostatistikgrupp). Institutionen ligger på campus Solna. Mer information finns på http://ki.se/meb.
Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?
Gruppen för prediktiv medicin är fokuserad på tillämpning av maskininlärning och AI för utveckling och validering av prediktiva modeller för biomedicinska tillämpningar, med ett särskilt intresse för cancerprecisionsmedicin och beräkningspatologi. Vår forskning är baserad på stora och högdimensionella dataset över flera modaliteter, inklusive molekylär, klinisk och histopatologisk bilddata. Vår beräkningspatologiska forskning är baserad på internationellt ledande och unika interna studiematerial och dataset.
Din roll
Denna forskningsingenjörsposition inkluderar att bidra till utveckling och validering av modeller baserade på djupinlärning och bildbehandlingsmetoder för cancerhistopatologiska bilddata. Maskininlärning och djupinlärningstekniker är centrala i detta beräkningspatologiprojekt som syftar till att förbättra cancerpatienters stratifiering.

Som forskningsingenjör kommer du att vara involverad i mjukvaruutveckling, datahantering, förbearbetning av data, data analys, och att bidra till forskningsaktiviteter inom området beräkningspatologi. Rollen skulle passa någon med en BSc i t.ex. matematik eller data vetenskap som har tidigare erfarenhet ifrån beräkningspatologi. Projektet Cancer Histopathology IMage Epidemiology (CHIME) fokuserar på storskaliga studier som inkluderar histopatologiska bilddata och klinisk information. Den framgångsrika sökande kommer att ingå i ett tvärvetenskapligt forskarteam med starkt samarbete med kliniska avdelningar och andra nationella och internationella forskargrupper.

Det här är en position med tillsvidareanställning.
Vem är du?
Du har kandidatexamen (eller motsvarande) i relevant ämnesområde.

För att kvalificera sig måste den sökande ha, eller förvänta sig att få, en BSc-examen (eller motsvarande) i ett relevant ämne och ha ett stort intresse för kvantitativa aspekter av medicinsk forskning. Förkunskaper inom ett relevant kvantitativt område (t.ex. matematik, maskininlärning, AI, epidemiologi, datorseende, biostatistik, epidemiologi) krävs samt tidigare erfarenhet av programmering. Tidigare erfarenhet ifrån arbete i forskningsmiljö som inkluderar mjukvaruutveckling, dataförbearbetning, dataanalys inom området beräkningspatologi är ett krav.

Den sökande ska ha tidigare kunskaper och erfarenhet av programmering i Python och det är önskvärt att den sökande även har tidigare erfarenhet av att arbeta med vanliga ramverk för djupinlärning, såsom Tensorflow/Keras eller Pytorch. Förkunskaper inom datavetenskap, tillämpad statistik, tillämpad maskininlärning och djupinlärning är också meriterande. Tidigare erfarenhet från att bidra till open source mjukvaruprojekt är meriterande. Den sökande ska kunna samarbeta väl både inom gruppen och i samarbete med externa parter, och också ha förmåga att arbeta självständigt och organisera och prioritera sina egna arbetsuppgifter med minimal handledning. Utmärkt skriftlig och muntlig kommunikationsförmåga på engelska krävs.

För ytterligare information kontakta docent Mattias Rantalainen (e-post: mattias.rantalainen@ki.se)
Vad erbjuder vi?
En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.

Placering: Solna

Tio skäl att välja Karolinska Institutet

Ansökan
KI tillämpar individuell och differentierad lönesättning enligt våra kollektivavtal RALS och RALS-T.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet.

Din ansökan ska även innehålla följande dokument på engelska och svenska:

• En fullständig meritförteckning
• En komplett lista över publikationer
• En sammanfattning av aktuellt arbete (högst en sida)

Vid tillsvidareanställning tillämpar Karolinska Institutet 6 månaders provanställning.
Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss