Doktorand i bioinformatik inom AI-baserad dataanalys inom precisionsmedicin

Högskolan i Skövde är en central och ledande aktör för utbildning, forskning och samverkan som stödjer omställningen för en hållbar framtid - regionalt, nationellt och internationellt. Våra 12 000 studenter och 460 medarbetare skapar förutsättningar för samhällets digitala transformation och hållbar samhällsutveckling genom högkvalitativ utbildning och forskning inom valda områden. Välkommen till ett levande campus mitt i Skaraborg.

Om oss

Institutionen för biovetenskap vid Högskolan i Skövde bedriver forskning och utbildning av hög internationell standard.Vi har väl utvecklade former för nationell och internationell samverkan mellan utbildning, forskning, näringsliv och övriga samhället. Institutionen för biovetenskap siktar på att vara en nationell nod inom biovetenskap.

Som doktorand kommer du att ingå i forskargruppen för translationell bioinformatik, som har lång erfarenhet av att utveckla metoder och verktyg för storskalig dataanalys inom livsvetenskaperna. Forskningsarbetet kommer huvudsakligen att inriktas på utveckling av nya metoder för precisionsmedicin, med särskilt fokus på bioinformatiska metoder för analys av storskaliga omikdata. Arbetet innefattar forskning inom förklarbar AI och modelltolkning, där experimentellt arbete kombineras med avancerade bioinformatiska och AI-baserade analystekniker. Projektet är ett samarbete mellan akademi och industri inom forskningsprofilen "AI-driven precisionsmedicin" som finansieras av Stiftelsen för kunskap- och kompetensutveckling. Arbetet kommer att bedrivas vid Högskolan i Skövde och Sahlgrenska Universitetssjukhuset i Göteborg. Som doktorand kommer du ha din tjänst inom Bioinformatik som på Högskolan i Skövde definieras som studier och utveckling av datorbaserade metoder och verktyg för analys, modellering, representation, och bearbetning av biomolekylära data. Doktorsexamen kommer att avläggas inom medicin i samarbete med Göteborgs Universitet.

Din roll

De huvudsakliga arbetsuppgifterna består av att bedriva forskning, utföra institutionsrelaterade tjänster samt hantera tillhörande administrativa uppgifter.

Ytterligare arbetsuppgifter kan komma att ingå i befattningen.

Behörighet

För tillträde till forskarutbildning på forskarnivå krävs grundläggande och i förekommande fall den särskilda behörighet som är fastställd i den allmänna studieplanen för forskarutbildningsämnet.

Grundläggande behörighet till forskarutbildning på forskarnivå har den som:

• avlagt examen på avancerad nivå, eller

• fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på

avancerad nivå, eller

• på annat sätt inom eller utom landet förvärvat motsvarande kunskaper.

Särskild behörighet till utbildning på forskarnivå i medicinsk vetenskap har den som:

med godkänt resultat fullgjort kurs engelska B/6 eller bedöms ha förvärvat motsvarande kunskaper genom tidigare studier (bedömningen görs i enlighet med Universitets- och högskolerådets

rekommendationer).

Bedömningsgrunder

Vid bedömningen fästs särskild vikt vid dokumenterade kvalifikationer avseende:

• God förmåga att tillgodogöra sig utbildning på forskarnivå.

• God samarbetsförmåga och god förmåga att arbeta såväl självständigt som i grupp.

• Förmåga att planera, organisera och uppnå uppsatta mål.

• Praktisk laboratorieerfarenhet av molekylärbiologiska metoder, exempelvis qPCR och western blot.

• Erfarenhet av statistik, bioinformatik och datavisualisering med hjälp av R, Python och Nextflow.

• Erfarenhet av högpresterande beräkningar (High-Performance Computing, HPC), TensorFlow, PyTorch och Keras för tillämpningar inom djupinlärning, samt praktisk erfarenhet av användning av variationell autokodare (variational autoencoders) och förklarbar AI (Explainable AI), exempelvis metoder som SHAP och integrerade gradienter (Integrated Gradients).

• Kunskap om analys av omikdata, inklusive single-cell RNA-sekvensering (single-cell RNA-seq) och proteomik.

Vid denna anställning kommer stor vikt att fästas vid erfarenhet av högpresterande beräkningar (High Performance Computing, HPC), TensorFlow, PyTorch och Keras för tillämpningar inom djupinlärning, samt praktisk erfarenhet av användning av variationell autokodare (variational autoencoders) och förklarbar AI (Explainable AI), exempelvis metoder som SHAP och integrerade gradienter (Integrated Gradients).

Anställningsform:

Anställningen är en visstidsanställning fram till och med avlagd doktorsexamen, dock längst 4,5 år. Anställningens omfattning är 100 %, varav 90 % forskarstudier och 10 % institutionstjänstgöring. Lön utgår enligt lokalt avtal om lönestege för forskarstuderande. Endast den som antas eller redan har antagits till en utbildning på forskarnivå får anställas som doktorand.

Sista ansökningsdatum: 16 november 2026

Diarienummer: Ref nr HS 2026/672

Kontaktuppgifter: Upplysningar om anställningen lämnas av avdelningschef Henrik Thilander (henrik.thilander@his.se) och projektledare Jane Synnergren (jane.synnergren@his.se). Facklig information lämnas av Anders Johansson (Saco-S) eller Maria Carlstedt (ST). Samtliga personer nås via Högskolans växel 0500-44 80 00.

Ansökan



Du söker anställningen via vår hemsida, www.his.se/jobb genom att klicka på "Ansök" längst ned i annonsen. Där kan du även läsa mer oss Högskolans rekryteringsprocess samt vilka förmåner du har som medarbetare hos oss. Välkommen med din ansökan!

Till din ansökan ska följande dokument bifogas:

• Personligt brev inklusive en intressebeskrivning engelska där du redogör för dina

forskningsintressen och förväntningar på forskarutbildningen

• CV

• Intyg, betyg och övriga merithandlingar du som sökande vill åberopa

• Examensbevis och betygsutdrag

• Examensarbete på magister- eller masternivå

• Eventuella publikationer

Kontakta HR-avdelningen på hr-specialister.hr@his.se om du har publikationer som inte kan bifogas elektroniskt direkt i ansökan. Publikationerna ska vara högskolan tillhanda senast en vecka efter sista ansökningsdatum.