Postdoktor inom multi-omik och maskininlärning

Vill du arbeta inom ett av världens snabbast växande teknologiområden, med stöd av kompetenta och trevliga kollegor i en internationell miljö? Vill du ha en arbetsgivare som satsar på ett hållbart medarbetarskap och erbjuder trygga, förmånliga arbetsvillkor? Välkommen att söka anställning som postdoktor på Uppsala universitet.

Institutionen för medicinska vetenskaper är en stor klinisk institution med ca 250 anställda och över 900 personer som är anknutna via Akademiska Sjukhuset. Institutionen har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inom en rad områden. Mer om institutionens verksamhet finns på www.medsci.uu.se.

Vi söker nu en driven forskare på postdoktornivå till forskargruppen för molekylär precisionsmedicin vid institutionen för medicinska vetenskaper som är verksam vid Biomedicinskt Centrum (BMC).

Forskargruppen studerar olika sjukdomar med hjälp av storskaliga genetiska metoder https://www.uu.se/en/department/medical-sciences/research/research-groups/molecular-precision-medicine. Genom nära samarbete med kliniska forskare vid Akademiska sjukhuset i Uppsala har vår forskargrupp tillgång till unika provsamlingar och klinisk patientinformation. Ett nära samarbete med den nationella infrastrukturen för genomik (National Genomics Infrastructure, NGI) vid Science for Life Laboratory (SciLifeLab), ger forskargruppen tillgång till nästa generationens sekvenseringsteknologi: https://ngisweden.scilifelab.se/.

Det aktuella projektet fokuserar på analys av blodprover från barn med leukemi, friska kontroller och in vitro-cellmodeller med hjälp av olika omik-tekniker. Det övergripande målet är att ta steget mot precisionsmedicin inom barnleukemi. Vi strävar efter att identifiera cirkulerande biomarkörer som kan särskilja högriskpatienter från patienter med låg risk. Med denna strategi vill vi kunna förkorta kemoterapibehandlingen för lågriskpatienter, samtidigt som vi riktar behandlingen mer specifikt mot högriskgruppen. Vi kommer även att genomföra läkemedelsscreeningar för riktade terapier, där vi testar lovande nya läkemedel som befinner sig i prekliniska och tidiga kliniska prövningar.

Finansierat av det transnationella European Partnership for Personalised Medicine (EP PerMed) är detta projekt ett nära samarbete med ledande forskargrupper inom barnhematologi vid University of Freiburg och Technical University of Munich i Tyskland samt University of Tampere i Finland. Som postdoktor i projektet kommer du att ha en nyckelroll i att integrera och analysera multiomik-data inom konsortiet för att fördjupa förståelsen av barnleukemi på molekylär nivå och bidra till utvecklingen av nya behandlingsstrategier.

Du kommer att ingå i Uppsala universitets forskargrupp för molekylär precisionsmedicin, där forskning fokuserar på både utveckling av nya genomiktekniker och tillämpningen av dessa för kliniskt relevanta frågor inom pediatrisk onkologi.

Arbetsuppgifter

Analysera multiomik-data från pediatriska leukemiprover och in vitro-modeller, inklusive genomik (WGS), transkriptomik (bulk och scRNA-seq), epigenomik (metyleringsarrayer) och proteomik (Olink Explore PEA, Illumina SomaSeq) data.

Utveckla och tillämpa maskininlärningsmodeller för att identifiera sjukdomssubtyper och förutsäga behandlingssvar.

Samarbeta med barnonkologer, bioinformatiker och beräkningsbiologer, både inom forskargruppen och med våra internationella samarbetspartners.

Författa vetenskapliga artiklar och presentera projektets resultat på vetenskapliga möten och konferenser.

Kvalifikationskrav

Doktorsexamen i bioinformatik, beräkningsbiologi, molekylärbiologi eller ett närliggande område, eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen inom något av dessa områden. Examen ska vara uppfylld senast vid tidpunkten för anställningsbeslutet. Främst bör den komma ifråga som har avlagt examen för högst tre år sedan. Vid beräkning av ramtiden om tre år är utgångspunkten sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan sådan examen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, etc.

Erfarenhet av storskalig dataanalys och programmering i relevanta språk som Python och R.

Vana vid att hantera stora dataset i LINUX/UNIX-miljö.

Erfarenhet av storskalig DNA- eller RNA-sekvensering.

Erfarenhet av analys av proteomikdata, inklusive data från affinitetsbaserade proteomikanalyser och/eller masspektrometri.

Utmärkta kommunikations- och samarbetsförmågor.

Goda muntliga och skriftliga kunskaper i engelska.

Önskvärt/meriterande i övrigt

Erfarenhet av integrering av multi-omikdata.

Kompetens inom maskininlärning för biomedicinska tillämpningar.

Om anställningen

Anställningen är tidsbegränsad i två år enligt centralt kollektivavtal, med eventuell möjlighet till förlängning ytterligare högst ett år. Omfattningen är heltid/100 %. Tillträde 1 oktober eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.

Upplysningar om anställningen lämnas av: Jessica Nordlund (jessica.nordlund@medsci.uu.se)

Välkommen med din ansökan senast den 9e september 2026, UFV-PA 2026/2468.

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 500 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet

https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/

Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.

Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Fackliga företrädare: Saco-S - saco-s@uu.se, Seko - seko@uadm.uu.se, ST (OFR/S) - ofr@uu.se