Doktorandtjänst inom multimodal artificiell intelligens för prostatacancer

Vill du bidra till att förbättra människors hälsa?
Att vara doktorand innebär att vara antagen till en utbildning på forskarnivå (forskarutbildning) där man följer en individuell studieplan. En doktorand ägnar sig åt ett forskningsprojekt under handledning, kompletterat med kurser och andra lärandeaktiviteter. För en doktorsexamen krävs motsvarande fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.

Institutionen för medicinsk epidemiologi och biostatistik bedriver forskning inom epidemiologi och biostatistik inom ett brett spektrum av områden inom biomedicinsk vetenskap. Institutionen är bland de största inom sitt område i Europa och har särskilt starka forskningsprofiler inom psykiatrisk, cancer-, reproduktiv, pediatrisk, farmakologisk, genetisk och geriatrisk epidemiologi, ätstörningar, precisionsmedicin, och biostatistik.

En del av framgången för institutionen beror på vår samarbetsanda, där en stor bidragande faktor är att forskare vid institutionen delar och samfinansierar gemensamma resurser (som t.ex. IT och en tillämpad biostatistikgrupp). Institutionen ligger på campus Solna. Mer information finns påhttp://ki.se/meb.
Forskargruppen
Med mer än 1,4 miljoner nya diagnoser varje år världen över är prostatacancer en av de vanligaste cancerformerna bland män. Forskningsgruppen för prostatacancer vid Karolinska Institutet är en tvärvetenskaplig och internationell ledande forskningsmiljö inriktad på att förbättra diagnostik, screening, prognos och behandling av prostatacancer genom precisionsmedicin, maskininlärning och artificiell intelligens.

Gruppen kombinerar storskaliga epidemiologiska resurser, innovativa kliniska prövningar, avancerad avbildning, genomik, digital patologi och multimodal AI. Forskningsmiljön omfattar unika longitudinella datamängder som STHLM0-registret, STHLM3- och STHLM3-MRI-studierna, samt storskaliga arkiv med digitaliserade patologibilder och prostata-MRI-undersökningar.

Gruppen samarbetar nära med kliniker, patologer, radiologer, statistiker och datavetare i Sverige och internationellt.
Doktorandprojektet och doktorandens uppgifter
Detta doktorandprojekt fokuserar på att utveckla nästa generations multimodala artificiella intelligenssystem för prostatacancer. Det övergripande målet är att förbättra kliniska beslutsfattande genom att integrera information från patologi, radiologi, biomarkörer, genomik och kliniska data till enhetliga och tolkningsbara AI-representationer av sjukdom.

Doktoranden kommer att arbeta inom flera sammankopplade projekt som involverar:

• Beräkningsmodeller för grundpatologi för prostatacancer
• AI-modeller för prostata-MR-analys
• Multimodal representationsinlärning som integrerar patologi, MR, genomik och kliniska data
• Transformatorbaserade multimodala fusionsmodeller
• Kausala och tolkningsbara AI-arkitektur för kliniskt beslutsstöd
• Kontrafaktiskt resonemang och modellering av sjukdomstillstånd

Arbetet kommer att involvera utveckling av djupinlärning och statistiska maskininlärningsmetoder för storskalig medicinsk avbildning och multimodala biomedicinska data. Studenten kommer att bidra till modellutveckling, validering och benchmarking med hjälp av några av världens största datamängder för prostatacancer.

Projektet kombinerar metodologisk AI-utveckling med klinisk relevant translationell forskning och erbjuder möjligheter till samarbete med internationella forskargrupper och deltagande i publikationer och konferenser med stor genomslagskraft.
Vad erbjuder vi?
Tio skäl att välja Karolinska Institutet
Karriärstöd för doktorander

• En mycket tvärvetenskaplig och internationell konkurrenskraftig forskningsmiljö
• Tillgång till unika världsledande prostatacancerdataset och kliniska prövningar
• Samarbete med ledande experter inom AI, statistik, radiologi, patologi och onkologi
• Möjligheter till internationellt samarbete och utbyte
• Tillgång till avancerad datorinfrastruktur för storskalig AI-utveckling
• Deltagande i banbrytande translationell AI-forskning med direkt klinisk relevans

Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Som doktorand vid KI erbjuds du ett individuellt forskningsprojekt, erfarna handledare, doktorandkurser och möjligheten att arbeta inom en internationell erkänd forskargrupp.

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Karolinska Institutet har samarbeten med framstående universitet över hela världen, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Som anställd doktorand får du en avtalsenlig lön, du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och du får ersättning för läkarvård.
Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå
För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande(A)och det särskilda(B)behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller

har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller

har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidanBehörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidanBedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

- Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidanEnglish language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas. Inlämnande av falska handlingar är ett brott mot svensk lag och anses vara grund för rättsliga åtgärder.
Färdigheter och personliga egenskaper
Sökanden ska ha en masterexamen i biostatistik, statistik, datavetenskap, bioinformatik, tillämpad matematik eller ett närbesläktat kvantitativt ämne.

En stark akademisk meritlista är mycket meriterande. Detta kan inkludera utmärkta betyg, dokumenterad utmärkelse i avancerade kvantitativa kurser eller tidigare utbildning vid internationellt ledande universitet eller högt rankade kvantitativa, biomedicinska eller folkhälsoforskningsmiljöer.

Starka kandidater bör visa erfarenhet inom flera av följande områden:

• Maskininlärning och djupinlärning
• Statistisk inlärning och probabilistisk modellering
• Datorseende eller biomedicinsk bildanalys
• Beräkningsbiologi eller biomedicinsk datavetenskap
• Prediktiv modellering och högdimensionell dataanalys
• Transformatorarkitekturer och grundmodeller
• Spatial omics eller grafbaserad modellering
• Naturlig språkbehandling och klinisk AI-utvärdering

Starka programmeringsfärdigheter krävs, särskilt i Python och/eller R. Erfarenhet av maskininlärningsramverk som PyTorch, TensorFlow, Scikit-learn, MONAI eller relaterade bibliotek är mycket önskvärt.

Vi lägger stor vikt vid personliga egenskaper i denna rekrytering. Den sökande bör ha stark analytisk förmåga, nyfikenhet, kreativitet och förmåga att arbeta självständigt såväl som i samarbete i tvärvetenskapliga team. Utmärkta kommunikationsfärdigheter i engelska, både skriftligt och muntligt, krävs. Tidigare forskningserfarenhet som resulterat i vetenskapliga rapporter, publikationer, öppen källkodsprogramvara eller konferenspresentationer är mycket meriterande.
Villkor
Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.


Ansökan
Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla dessa dokument:

- Ett personligt brev som beskriver dina forskningsintressen och motivation
- Curriculum vitae
- Examensbevis och betygsutdrag
- Tidigare examensarbeten, avhandlingar, publikationer eller tekniska rapporter, om tillämpligt
- Andra relevanta dokument som visar programmerings-, maskininlärnings- eller forskningserfarenhet
- Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper
- Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (seAovan)
- Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (seBovan)
Urval
Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

- Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
- Analytisk och metodologisk skicklighet
- Programmerings- och teknisk kompetens
- Forskningserfarenhet och vetenskaplig mognad
- Förmåga att arbeta självständigt och i samarbete
- Personlig lämplighet och motivation
- Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning

Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.

Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet