Postdoktor i T-cellsadaptering i mänskliga vävnader

Vill du bidra till att förbättra människors hälsa?
Vi söker en engagerad postdoktor med stark kompetens inom human immunologi för att ansluta sig till vårt team som studerar T-cellers adaptering i vävnader. Vi erbjuder en stimulerande och kreativ forskningsmiljö vid Karolinska Institutet i framkanten av translationell immunologi och cancerforskning.
Din roll
Marcus Buggerts forskargrupp vid Centrum för infektionsmedicin (CIM) bedriver ledande forskning om mänskliga T-cellsresponser vid virusinfektioner, vaccination och cancer. Vår forskning är starkt translationell och bygger på unika humana provmaterial från blod och vävnader, kombinerat med avancerade metoder såsom högparametrisk flödescytometri, MHC-multimerteknologi, single-cell- och multi-omics-tekniker, TCR-sekvensering, epigenetiska analyser, organoidmodeller och funktionella T-cellsanalyser.

Den postdoktorala forskaren kommer att arbeta med ett projekt som fokuserar på hur CD8+ T-celler anpassar sig till olika vävnadsmiljöer i människan. En central fråga är om T-celler med samma virusspecificitet får olika fenotypiska, transkriptionella, epigenetiska och funktionella egenskaper beroende på om de befinner sig i exempelvis blod, lunga, lymfkörtlar, tonsill, tarm eller mjälte. Projektet kommer särskilt att undersöka T-celler riktade mot olika typer av virus för att förstå hur akut, kronisk och latent virusimmunitet organiseras i olika vävnader.

Arbetet kommer att kombinera djup fenotypning av humana vävnadsprover med single-cell RNA-seq, ATAC-seq, TEA-seq, TCR-seq och DNA-barkodade MHC-multimerer. Projektet kommer även att använda vävnadsbaserade organoidmodeller och adoptiva transfer-system för att undersöka om T-cellernas vävnadsprägel är stabil eller om den kan förändras när cellerna exponeras för en ny mikromiljö. Genom funktionella experiment kommer postdoktorn att studera hur vävnadsanpassade T-celler kontrollerar virusinfekterade celler, producerar cytokiner, reglerar cytotoxicitet och samtidigt begränsar potentiell vävnadsskada.

Projektet syftar till att skapa en mer mekanistisk förståelse av hur mänskliga T-celler anpassas till sina lokala vävnadsmiljöer och hur denna anpassning påverkar immunologiskt skydd. På längre sikt kan kunskapen bidra till förbättrad vaccindesign, utveckling av vävnadsriktade immunterapier och en djupare förståelse av varför T-celler fungerar olika beroende på var i kroppen de befinner sig.
Vem är du?
För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara en svensk doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

För att kvalificera dig för postdoktorstjänsten krävs en doktorsexamen i biomedicin, immunologi, virologi, cellbiologi eller ett närliggande område, samt dokumenterad erfarenhet av human immunologi. Den ideala kandidaten har gedigen erfarenhet av T-cellsbiologi, flödescytometri och funktionella immunologiska analyser. Erfarenhet av arbete med humana vävnadsprover, virus-specifika T-cellsresponser, MHC-multimerer, single-cell-tekniker, organoidmodeller eller avancerad bioinformatisk analys är starkt meriterande.

Vi söker en person som är vetenskapligt driven, noggrann och självständig, men som också trivs i ett tvärvetenskapligt team där experimentell immunologi, kliniska samarbeten och beräkningsbaserade analyser integreras. Du bör ha förmåga att driva ett komplext projekt framåt, bidra till metodutveckling och aktivt delta i gruppens vetenskapliga diskussioner. Första författarpubliceringar i välrenommerade vetenskapliga tidskrifter är meriterande. Mycket god förmåga att kommunicera på engelska, både muntligt och skriftligt, är ett krav.

Det är särskilt meriterande att den sökande har

• Utbildats inom T-cellsimmunologi eller virusimmunologi under sin doktorandutbildning
• Erfarenhet av att analysera humana T-celler från vävnad, blod eller kliniska kohorter
• Erfarenhet av högparametrisk eller spektral flödescytometri
• Erfarenhet av MHC-I- eller MHC-II-multimerbaserade analyser av antigen-specifika T-celler
• Goda kunskaper i statistisk analys och hantering av högdimensionella dataset
• Erfarenhet av funktionella T-cellsanalyser, cellodling, co-culture-system eller organoidmodeller
• Flytande engelska i tal och skrift

Det är även meriterande att den sökande har

• Laboratoriemolekylära och cellbiologiska färdigheter (t.ex. beredning av RNAseq-bibliotek, ATAC-seq-bibliotek, etc)

Efter en samlad bedömning av de sökandes kompetens och meriter i förhållande till ämnesområdet kommer Karolinska Institutet att avgöra vilken av dem som har bäst potential att bidra till en positiv utveckling av verksamheten vid KI.
Vad erbjuder vi?
En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Placering: Flemingsberg

Läs mer om forskargruppen här
Läs mer om CIM här
Tio skäl att välja Karolinska Institutet

Ansökan
Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

• Bevis om doktorsexamen
• Ett komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
• En komplett publikationslista
• En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)

KI tillämpar individuell och differentierad lönesättning enligt våra kollektivavtal RALS och RALS-T.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.
Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss!