Forskningsassistent (1–2 tjänster) inom encellsproteomik vid mitokondriella sjukdomar

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?
Institutionen för medicinsk biokemi och biofysik (MBB)är en av de största institutionerna vid Karolinska Institutet och fokuserar på grundforskning inom biomedicin. Vi har en lång och stolt tradition av banbrytande forskning, särskilt när det gäller att utveckla innovativa metoder och tillämpa dem för att förstå grundläggande mänsklig biologi och sjukdomsmekanismer.

MBB ligger i det nybyggda forskningscentret Biomedicum tillsammans med fyra andra institutioner. Här blir du del av en levande forskningsmiljö med över tusen forskare, förstklassiga faciliteter och en unik bredd av kompetenser. Biomedicum ligger nära både Karolinska Universitetssjukhuset (för kliniska samarbeten) och Science for Life Laboratory, en nationell forskningsinfrastruktur med unika teknologier.

Du kommer att arbeta i forskargruppen"Proteomes of Metabolism"under ledning av biträdande lektor Florian Rosenberger. Vi utvecklar och tillämpar den senaste masspektrometritekniken ner till encellsnivå för att besvara en grundläggande fråga: varför påverkar metabola sjukdomar, särskilt mitokondriella defekter, olika celltyper på olika sätt?
Din roll
Som forskningsassistent kommer du att använda vår pipeline för spatial proteomik (Deep Visual Proteomics) för att generera kvantitativa proteomikdata från vävnadsprover. Du kommer att:

• Undersöka hur metabola signalvägar kopplas om vid mitokondriella defekter.
• Implementera metoder för in situ-sekvensering och avancerad bildanalys.
• Analysera perturbationsdataset inom proteomik med hjälp av maskininlärning.

Du samarbetar nära med experter inom mitokondriebiologi och proteomik i en tvärvetenskaplig och internationell forskningsmiljö. Arbetsspråket är engelska.
Vem är du?
Du har enmasterexamen i molekylärbiologi, bioteknik, bioinformatik eller ett närliggande område, med en experimentell och/eller beräkningsinriktad profil. Vi söker en motiverad, kreativ och nyfiken kollega med ett starkt intresse för tvärvetenskaplig forskning. Personlig lämplighet är av stor betydelse vid bedömningen av de sökande.

Krav:

• Stark motivation för tvärvetenskaplig teknikutveckling och kreativ problemlösning.
• Erfarenhet av att tolka biologiska data och pröva hypoteser experimentellt.
• Molekylärbiologiska metoder, inklusive cellodling.
• Erfarenhet av CRISPR-baserade metoder.
• God samarbets- och kommunikationsförmåga.
• Starkt intresse för analys av omics- och/eller bilddata (Python och/eller R).

Meriterande:

• Erfarenhet av proteomik och masspektrometri.
• Kunskap inom mitokondriebiologi eller metabolism.
• Dokumenterad erfarenhet av translationell forskning.

Vad erbjuder vi?
En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.

Placering: Biomedicum, Solna

Ansökan
Välkommen med din ansökan senast2026-06-08via Varbi rekryteringssystem. Ansökan sker medCV och personligt brev. Därutöver ska du bifoga ett lösningsförslag på följande uppgift:

Din uppgift är att spåra prover från provrör till dataanalys via ett databassystem och streckkoder eller liknande. Anta att du har en veckas heltidsarbete med kodning och en hårdvarubudget på 10 kSEK, och att allt annat måste vara gratis eller redan finnas i labbet. Beskriv hur du skulle bygga v1, vad du medvetet skulle välja bort, och hur ditt system skulle bete sig i tre specifika felscenarier:

En platta blir felmärkt vid LMD-steget.

En patient drar tillbaka sitt samtycke tre månader efter MS-akvisitionen.

En råfil bearbetas på nytt sex månader senare med en uppdaterad programvaruversion.

Inlämningen ska rymmas på en sida och innehålla en figur. Använd gärna de verktyg som hjälper dig att tänka, men var beredd att diskutera dina val vid en eventuell intervju.
Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss