Doktorandplats inom proteomik och insulinresistens vid metabol sjukdom

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?
Att vara doktorand innebär att vara antagen till en utbildning på forskarnivå (forskarutbildning) där man följer en individuell studieplan. En doktorand ägnar sig åt ett forskningsprojekt under handledning, kompletterat med kurser och andra lärandeaktiviteter. För en doktorsexamen krävs motsvarande fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.

Institutionen för mikrobiologi, tumör- och cellbiologi (MTC) vid Karolinska Institutet bedriver forskning och undervisning inom immunologi, infektionsbiologi, cellbiologi och cancer. Våra nyckelord är multidisciplinära, överbryggande, nationella och internationella samarbeten.
Forskargruppen
Den blivande doktoranden kommer att ingå i Dr. Amir Ata Saeis forskargrupp vid institutionen för mikrobiologi, tumör- och cellbiologi (MTC), Karolinska Institutet. Saei Lab utvecklar och använder masspektrometribaserad proteomik, kemisk proteomik och multi-omics för att förstå hur metaboliter och andra små molekyler reglerar proteiners funktion och sjukdomsbiologi. Gruppen kombinerar proteomik, bioinformatik, biokemi och cellmodeller för att gå från hypotesoberoende molekylära fynd till mekanistisk validering. Doktorandprojektet bedrivs i en samarbetsmiljö med expertis inom klinisk metabolism, fettvävnadsbiologi, metabolomik och humana cellmodeller. För mer information, se www.SaeiLab.com eller kontakta Dr. Saei på amir.saei@ki.se.
Doktorandprojektet och doktorandens uppgifter
Du kommer att arbeta i ett projekt som syftar till att definiera de molekylära mekanismer som driver insulinresistens i adipocyter och hur denna reverseras efter bariatrisk kirurgi, i samarbete med professor Mikael Rydéns och professor Yihai Caos forskargrupper. Projektet omfattar proteomikanalys av fettvävnads- och plasmaprover från individer som genomgår bariatrisk kirurgi för viktnedgång. Du kommer att integrera djupgående plasmaproteomik, oriktad metabolomik och multifacetterad vävnadsproteomik för att identifiera cirkulerande faktorer och processer i fettvävnaden som samvarierar med förbättrad insulinkänslighet. Arbetet kombinerar masspektrometribaserad proteomik, kvantitativ dataanalys, bioinformatik och multi-omics-integration. I vit fettvävnad kommer du att studera proteiners mängd och stabilitet med hjälp av avancerade proteomikanalyser. Prioriterade proteiner eller metaboliter kommer därefter att testas i humana 3D-sfäroider av adipocyter med funktionella mätningar. Mekanistisk uppföljning kan omfatta CRISPR/Cas9 eller gen-nedreglering, och de starkaste kandidaterna kan gå vidare till fokuserad in vivo-validering tillsammans med samarbetspartners. Doktoranden förväntas planera och genomföra experiment, analysera och tolka data, presentera resultat, bidra till manuskript och samarbeta aktivt med de deltagande forskargrupperna.
Vad erbjuder vi?
En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Som doktorand erbjuds du ett individuellt forskningsprojekt, en välutbildad handledare, ett stort utbud av valbara kurser och möjligheten att arbeta i en framgångsrik forskargrupp. Karolinska Institutet har samarbeten med framstående universitet över hela världen, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Som anställd doktorand får du en avtalsenlig lön, du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och du får ersättning för läkarvård.
Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå
För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande (A) och det särskilda (B) behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

Har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller

Har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller

Har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidan Bedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

• Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidan English language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument: Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas. Inlämnande av falska handlingar är ett brott mot svensk lag och anses vara grund för rättsliga åtgärder.
Färdigheter och personliga egenskaper
Utöver ovan nämnda krav för rollen:

• Du är mycket motiverad och nyfiken och kan ta ansvar för ett långsiktigt forskningsprojekt, samtidigt som du arbetar både självständigt och i nära samarbete med andra.
• Du har en stark utbildningsbakgrund inom biomedicin, molekylärbiologi, biokemi, bioteknik, metabolism eller ett närliggande område.
• Du har praktisk forskningserfarenhet inom minst två områden som är relevanta för projektet, till exempel odling av däggdjursceller, molekylärbiologi/biokemi eller kvantitativ analys av biologiska data.
• Du har erfarenhet av bioinformatik/statistik och R eller Python för analys av stora biologiska datamängder.
• Du har god analytisk och problemlösande förmåga, är välorganiserad och kan dokumentera och kommunicera vetenskapligt arbete tydligt.
• Du har mycket goda kunskaper i engelska i tal och skrift och trivs i en tvärvetenskaplig och internationell forskningsmiljö.

Meriterande för rollen:

• Erfarenhet av masspektrometribaserad proteomik eller metabolomik, inklusive provberedning eller kvantitativ omik-analys.
• Erfarenhet av metabolism, adipocytbiologi, insulinsignalering, obesitas, typ 2-diabetes eller närliggande metabol forskning.
• Erfarenhet av 3D-cellodling, CRISPR/Cas9 eller gen-nedreglering, metabola funktionsanalyser eller andra metoder för funktionell validering.
• Erfarenhet av arbete med humana prover eller ett forsknings-/examensarbete som har resulterat i en publikation eller motsvarande vetenskapligt resultat.

Villkor
Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.
Ansökan
Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla dessa dokument:

• Ett personligt brev och curriculum vitae
• Eventuella examensarbeten och publikationer
• Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper
• Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (se A ovan)
• Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (se B ovan)

Urval
Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

• Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
• Analytisk skicklighet
• Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning

Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.

KI tillämpar en lönestege vid lönesättning av doktorander.

www.SaeiLab.com
https://ki.se/en/mtc
Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet!