Doktorand till avdelningen för Patologi

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?
Att vara doktorand innebär att vara antagen till en utbildning på forskarnivå (forskarutbildning) där man följer en individuell studieplan. En doktorand ägnar sig åt ett forskningsprojekt under handledning, kompletterat med kurser och andra lärandeaktiviteter. För en doktorsexamen krävs motsvarande fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.
Forskargruppen
Vincents forskargrupp undersöker hur ribosombiogenes och translationell kontroll driver cellplasticitet i cancer. En central upptäckt från gruppen visade att ribosombiogenes inte enbart är en hushållsprocess utan en aktiv regulatorisk mekanism under epitelial-mesenkymal transition (EMT). Gruppen tillämpar ett integrerat experimentellt tillvägagångssätt som kombinerar ribosomprofilering, polysomanalys, linjespårningsmusmodeller, avancerad mikroskopi och multi-omik-dataanalys.
Doktorandprojektet och doktorandens uppgifter
Detta doktorandprojekt syftar till att klarlägga grundläggande mekanismer för translationell reglering vid angiogenes, med särskilt fokus på translationsinitiering och ribosomheterogenitet. Det övergripande målet är att definiera hur specialiserade ribosomer och icke-kanonisk translationsinitiering samverkar för att kontrollera endotelcellsplasticitet och angiogenes i hälsa och sjukdom.

Den första delen av doktorandstudierna kommer att använda Cre-lox-linjespårningsmusmodeller för att åstadkomma endotelcellsspecifik knockout av gener av intresse, och utvärdera de funktionella konsekvenserna för tumörtillväxt och vaskulär ombyggnad in vivo. Enkelcells-RNA-sekvensering kommer att tillämpas för att kartlägga transkriptionella förändringar och cellstatusskiften inom tumörvaskulaturen på enkelcellsnivå.

Med utgångspunkt i dessa in vivo-fynd kommer doktoranden att karakterisera de underliggande molekylära mekanismerna med hjälp av endotelcellsodlingsmodeller. Detta kommer att innefatta funktionella angiogenesstudier tillsammans med avancerade translationsanalyser - inklusive polysomprofilering och ribosomprofilering - för att definiera hur translationella program förändras vid genetisk perturbation. Centrala fynd kommer att valideras på patientderivierade vävnader.

Den tredje delen kommer att undersöka rollen för translationsinitierings-faktorer i extracellulär vesikels (EV) biogenes i endotelceller. Genetiska perturbationsstrategier kommer att användas för att undersöka hur translationsinitiering reglerar EV-produktion och lastning av innehåll, följt av en omfattande karakterisering av EV-biogenes och EV-innehåll. De funktionella konsekvenserna av dessa EV:er kommer sedan att utvärderas genom att isolerade EV:er överförs till cancerceller och deras effekter bedöms via funktionella in vitro-analyser, in vivo-modeller och molekylärmekanistiska analyser.

Doktoranden kommer att utföra ett brett spektrum av experimentella uppgifter, inklusive endotelcellsodling, linjespårningsmusarbete, enkelcells- och bulk-RNA-sekvensering, polysom- och ribosomprofilering, EV-isolering och karakterisering, CRISPR-baserad geneditering samt avancerad fluorescensmikroskopi. Doktoranden kommer även att bidra till det dagliga arbetet i laboratoriet samt delta i gruppens seminarie- och tidskriftsklubbsaktiviteter.
Vad erbjuder vi?
En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Som doktorand erbjuds du ett individuellt forskningsprojekt, en välutbildad handledare, ett stort utbud av valbara kurser och möjligheten att arbeta i en framgångsrik forskargrupp. Karolinska Institutet har samarbeten med framstående universitet över hela världen, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Som anställd doktorand får du en avtalsenlig lön, du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och du får ersättning för läkarvård.
Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå
För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande (A) och det särskilda (B) behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller

har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller

har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidan Bedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

- Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidan English language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas. Inlämnande av falska handlingar är ett brott mot svensk lag och anses vara grund för rättsliga åtgärder.
Färdigheter och personliga egenskaper

• Bakgrund inom molekylärbiologi, cellbiologi, biokemi, biomedicinska vetenskaper eller ett närliggande område
• Dokumenterad praktisk erfarenhet av experimentellt laboratoriearbete
• Erfarenhet av däggdjurscellsodling och molekylärbiologiska tekniker (kloning, qPCR, western blot, immunofluorescens)
• Goda kunskaper i engelska, i såväl tal som skrift
• Förmåga att arbeta självständigt såväl som i samarbete inom en mångvetenskaplig miljö

Meriterande kvalifikationer

• Erfarenhet av vaskulärbiologi, inklusive endotelcellsodling eller in vivo-angiogenesmodeller
• Erfarenhet av in vivo-musmodeller, inklusive Cre-lox-linjespårningssystem
• Flödescytometri och/eller fluorescensaktiverad cellsortering (FACS)
• Erfarenhet av translationsrelaterade analyser (polysomprofilering, ribosomprofilering eller liknande)
• Vana vid bioinformatisk analys med R eller Python (bulk-RNA-seq, Ribo-seq eller scRNA-seq)

Villkor
Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.

Ansökan
Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla dessa dokument:

- Ett personligt brev och curriculum vitae
- Eventuella examensarbeten och publikationer
- Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper
- Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (se A ovan)
- Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (se B ovan)
Urval
Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

- Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
- Analytisk skicklighet
- Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning

Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.

KI tillämpar en lönestege vid lönesättning av doktorander.
Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet