Bioinformatiker i klinisk genetik

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens främsta lärosäten. Här finns omkring 46 000 studenter och 8 500 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.

Beskrivning av arbetsplatsen

Vid Avdelningen för klinisk genetik, Institutionen för laboratoriemedicin, söker vi en bioinformatiker som ska arbeta med att utveckla klassificeringsalgoritmer för genuttrycksdata inom blodcancerområdet. Projektet fokuserar på att utveckla och utvärdera klassificeringsalgoritmer baserade på stora datamängder från RNA-sekvensering av blodcancerceller, med syfte att förbättra den kliniska diagnostiken.

Forskargruppen leds av professor Thoas Fioretos och består av cirka tio medarbetare med expertis inom genuttrycksanalys, singelcellsanalys, bioinformatik samt funktionella och mekanistiska studier av blodcancer. Gruppen är internationell, arbetar tvärvetenskapligt och har etablerade samarbeten med andra forskargrupper, hälso- och sjukvården samt life science-industrin.

Vi söker nu en bioinformatiker med mycket goda kunskaper inom maskininlärning och statistisk analys samt dokumenterad erfarenhet av att arbeta med genuttrycksdata inom blodcancerområdet. Arbetet bedrivs både självständigt och i nära samarbete med gruppens övriga medarbetare, däribland bioinformatiker och doktorander.

Som arbetsplats värnar vi om en god arbetsmiljö präglad av respekt, omtanke och ett öppet samarbetsklimat.

Vi erbjuder

Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension. Vi har även ett flextidsavtal som skapar goda förutsättningar för balans mellan arbete och fritid.

Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd vid Lunds universitet, Jobba hos oss.

Arbetsuppgifter och ansvarsområden

Du kommer att ingå i ett team av bioinformatiker och doktorander som utvecklar metoder för att förbättra den kliniska diagnostiken av blodcancer genom analys av genuttrycksdata. I arbetsuppgifterna ingår att utveckla bioinformatiska analysverktyg, tillämpa och vidareutveckla maskininlärningsbaserade klassificeringsalgoritmer samt utvärdera om neurala nätverk kan förbättra klassificeringen. Eftersom forskningen är datadriven kan arbetet även innefatta utveckling och tillämpning av andra bioinformatiska, matematiska och statistiska metoder.

Kvalifikationer

Krav för anställningen är:

Doktorsexamen inom bioinformatik, datavetenskap, fysik, matematik eller annat relevant tekniskt eller naturvetenskapligt område

Mycket goda kunskaper och dokumenterad erfarenhet av programmering, dataanalys, statistisk modellering och maskininlärning

Dokumenterad erfarenhet av att utveckla och utvärdera maskininlärningsmodeller baserade på genuttrycksdata eller andra högdimensionella biologiska data inom blodcancerområdet

Mycket god förmåga och dokumenterad erfarenhet av att arbeta självständigt samt i tvärvetenskapliga team med flera samarbetspartner

Mycket god förmåga att kommunicera på svenska och engelska i tal och skrift

Meriterande för anställningen är:

Erfarenhet av Pythonbaserade verktyg för maskininlärning samt metoder för modelloptimering, validering och förklarbar maskininlärning

Erfarenhet av att utveckla eller utvärdera neurala nätverk för klassificering av biologiska eller kliniska data

Erfarenhet av teambaserat arbete i en större tvärvetenskaplig forskargrupp samt av att författa vetenskapliga texter och presentera vetenskapliga resultat.

Övrigt

Anställningen är en Särskild visstidsanställning (SÄVA) på deltid (50%) i 12 månader med önskat startdatum den 2026-09-01, eller enligt överenskommelse.

Så här söker du

Anställningen söks via universitetets rekryteringssystem. Ansökan ska innehålla ett personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt anställningen matchar dina meriter. Ansökan ska även innehålla CV, examensbevis eller motsvarande samt övrigt som du önskar åberopa (kopior av betyg, uppgifter till referenser, rekommendationsbrev etc.)

Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Ange gärna löneanspråk i din ansökan.

Medicinska fakulteten är ett verksamhetsområde inom Lunds universitet, med ansvar för utbildning och forskning inom medicin, vård och hälsa. Utbildningen sker i nära samverkan med sjukvården och är väl förankrad i fakultetens starka forskningstradition. Fakultetens forskning spänner över ett brett fält inom experimentell grundforskning, patientnära klinisk forskning och hälsovetenskaplig forskning. Medicinska fakulteten, med drygt 1800 anställda och 3000 studenter i Lund, Malmö och Helsingborg, är en kunskapsintensiv mötesplats för studenter, lärare och forskare från hela världen.

Institutionen för laboratoriemedicin (ILM) är en av sex institutioner vid Medicinska fakulteten. Vi bedriver ledande forskning inom det laboratoriemedicinska fältet med fokus på hur sjukdomar uppkommer och hur vi kan förbättra patienters diagnostik och behandling. Några av våra starkaste områden med forskning i världsklass, handlar om cancer-, genetik- och blodforskning.

Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler.