Doktorandplats inom mukosal immunologi

Om jobbet

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?
Att vara doktorand innebär att vara antagen till en utbildning på forskarnivå (forskarutbildning) där man följer en individuell studieplan. En doktorand ägnar sig åt ett forskningsprojekt under handledning, kompletterat med kurser och andra lärandeaktiviteter. För en doktorsexamen krävs motsvarande fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.
Forskargruppen
Elisabeth Nyströms grupp inom avdelningen för Immunologi och lungmedicin är en interdisciplinär grupp som undersöker hur epitel bildar och reglerar skyddande barriärer mot omgivningen. Vi fokuserar på hur tarmens slemlager och slemproducerande bägarceller formar ett dynamiskt gränssnitt mellan kroppen och vår omgivning, och hur den styr mikrobiota interaktioner, näringsutbyte samt immunaktivering. Genom att integrera molekylärbiologi, biokemi och fysiologi arbetar vi för att förstå hur slemlagret fungerar och regleras vid hälsa och sjukdom.

Gruppen är en del av avdelningen för Immunologi och lungmedicin vid Institutionen för medicin, Solna. Labbet har nära interaktioner inom immunologi, bioinformatik, strukturbiologi, biokemi och klinisk forskning, både lokalt och internationellt.
Doktorandprojektet och doktorandens uppgifter
I projektet kommer doktoranden att undersöka hur olika slemproducernade cellpopulationer formar slemlagrets egenskaper, och hur förändringar i deras sammansättning påverkar slemlagrets funktion genom reglering av posttranslationella modifieringar av utsöndrade proteiner. Bakteriella och parasitbaserade tarminfektionsmodeller med kommer att användas som modellsystem där bägarcellssammansättning och slemlagrets egenskaper förändras.

Doktoranden kommer att använda singelcells-RNA-sekvensering (scRNA-seq) för att karakterisera bägarcellspopulationer, i kombination med ex vivo-plattformar för analys av slemlagret för att koppla cellulär sammansättning till funktion. Därutöver kommer masspektrometribaserade metoder att användas för att studera posttranslationella modifieringar.

Projektet innefattar experimentellt arbete i djurmodeller, och doktoranden kommer att ansvara för att utföra infektionsförsök, inklusive hantering och propagering av relevanta bakteriella eller parasitära organismer, samt monitorering av sjukdomsförlopp. Vissa moment kan kräva flexibilitet i arbetstider, inklusive arbete utanför ordinarie arbetstid eller under helger.

Doktoranden förväntas driva sitt projekt framåt med ökande grad av självständighet, samtidigt som hen aktivt deltar i forskargruppens arbete. Samarbete inom teamet och bidrag till en välfungerande laboratoriemiljö är viktiga delar av rollen.
Vad erbjuder vi?
En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Som doktorand erbjuds du ett individuellt forskningsprojekt, en välutbildad handledare, ett stort utbud av valbara kurser och möjligheten att arbeta i en framgångsrik forskargrupp. Karolinska Institutet har samarbeten med framstående universitet över hela världen, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Som anställd doktorand får du en avtalsenlig lön, du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och du får ersättning för läkarvård.
Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå
För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande(A)och det särskilda(B)behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller

har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller

har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidanBehörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidanBedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

- Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidanEnglish language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas. Inlämnande av falska handlingar är ett brott mot svensk lag och anses vara grund för rättsliga åtgärder.
Färdigheter och personliga egenskaper
Krav:

• Masterexamen i molekylärbiologi, biokemi, cellbiologi, biomedicin eller närliggande område med stark experimentell inriktning
• Dokumenterad erfarenhet av experimentellt laboratoriearbete inom relevanta områden såsom cellbiologi, mikrobiologi eller molekylärbiologi
• Certifiering för arbete med försöksdjur (mus) samt dokumenterad erfarenhet av djurarbete Goda kunskaper i engelska, både i tal och skrift

Meriterande:

• Erfarenhet av tarminfektionsmodeller eller mikrobiologi (bakteriell eller parasitär)
• Erfarenhet av transcriptomic, inklusive preparering av vävnad för t.ex. RT-pPCR eller scRNA-seq, samt dataanalys
• Grundläggande bioinformatiska kunskaper (t.ex. R eller Python) samt erfarenhet av att hantera stora datamängder
• Erfarenhet av proteomik, masspektrometri eller analys av posttranslationella modifieringar
• Erfarenhet av avancerade avbildningstekniker, gärna med konfokalmicrospi
• Ex vivo-vävnadsanalyser inklusive organskörd och dissektion, gärna med erfarenhet av tarmpreparering.

Personliga egenskaper

Vi lägger stor vikt vid personliga egenskaper i denna rekrytering. Som person är du:

• Analytisk, strukturerad och noggrann, med ett starkt engagemang för arbete av hög kvalitet och ett intresse för att lösa komplexa forskningsfrågor
• Självständig och initiativtagande, med förmåga att driva projekt framåt samtidigt som du söker stöd och lyfter utmaningar på ett konstruktivt sätt när det behövs
• Nyfiken och motiverad att lära dig nya metoder, färdigheter och koncept, med uthållighet och förmåga att slutföra påbörjade uppgifter
• Samarbetsinriktad, med god kommunikativ förmåga och bekväm i att arbeta i interdisciplinära team med olika bakgrunder
• Villig att bidra till en positiv och välfungerande laboratoriemiljö

Villkor
Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.

--[Video om Karolinska Institutet, hur vi alla bidrar till en bättre hälsa för alla] ---

Ansökan
Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla dessa dokument:

- Ett personligt brev och curriculum vitae
- Eventuella examensarbeten och publikationer
- Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper
- Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (seAovan)
- Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (seBovan)
Urval
Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

- Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
- Analytisk skicklighet
- Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning

Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.

Immunologi och lungmedicin

Elisabeth Nyström
Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet