Postdoktor i mänskliga organoider och virusinfektionsbiologi

Om jobbet

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?
Laboratoriet för systemvirologi vid Karolinska Institutet ligger i framkant när det gäller att förstå hur virus interagerar med den mänskliga värden på systemnivå. Genom att integrera banbrytande multioomiska metoder på encellsnivå med avancerade experimentella modeller, såsom humana organoider, kartlägger laboratoriet de molekylära och cellulära mekanismer som styr viral patogenes, immunundvikande och sjukdomsförlopp. Vår forskning spänner över ett brett spektrum av kliniskt relevanta virus, med särskilt fokus på retrovirus (t.ex. HIV, HTLV) och arbovirus (t.ex. dengue, zika), där vi undersöker hur dynamiken mellan värd och virus påverkar utfallet i olika vävnader. Genom att kombinera beräkningsbaserad systembiologi med rigorös experimentell virologi omvandlar vi komplexa biologiska data till mekanistiska insikter med direkt relevans för terapeutisk och diagnostisk innovation. Laboratoriet är baserat vid ett av världens ledande medicinska universitet och främjar en internationell, samarbetsinriktad och intellektuellt ambitiös miljö där forskare i början av sin karriär ges möjlighet att utvecklas som självständiga forskare och bidra till vetenskap som gör skillnad. Det aktuella projektet ingår i EU:s Horisont-projekt COMBAT och andra projekt som stöds av Vetenskapsrådet.
Din roll
Som postdoktor vid laboratoriet för systemvirologi är ditt uppdrag att flytta fram gränserna för forskningen om viruspatogenes med hjälp av de senaste modellerna för humana organoider. Du kommer att ha det övergripande ansvaret för att skapa, underhålla och differentiera organoider från hjärna, tarm och moderkaka samt optimera robusta protokoll som utgör den experimentella grunden för laboratoriets forskningsprogram.
Vem är du?
För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara en svensk doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

Den ideala kandidaten för tjänsten har en doktorsexamen i virologi, cellbiologi, utvecklingsbiologi, neurovetenskap eller ett närbesläktat biomedicinskt område, med en gedigen praktisk bakgrund inom 3D-cellodlingssystem såsom organoider eller sfäroider. Direkt erfarenhet av att generera, underhålla och differentiera minst en av de aktuella organoidtyperna - hjärna, tarm eller placenta - är nödvändig, helst i kombination med förtrogenhet med odlings- och differentieringsprotokoll för iPSC.

Du bör vara skicklig i konfokal- och fluorescensmikroskopi, standardtekniker inom molekylärbiologi samt immunofluorescens på 3D-vävnadssektioner; erfarenhet av enkelcells-RNA-sekvensering eller CRISPR skulle ytterligare stärka ansökan.

Utöver tekniska färdigheter kräver rollen någon som är mycket självständig, ansvarsfull och kapabel att optimera och felsöka komplexa protokoll med minimal övervakning, eftersom organoidsystemen kommer att fungera som den experimentella ryggraden i hela forskningsprogrammet. Förmågan att utbilda juniora labbmedlemmar, bidra till vetenskapligt skrivande och samarbeta effektivt inom ett tvärvetenskapligt team är lika viktigt. Du har sannolikt avlagt doktorsexamen inom hjärn- eller tarmorganoidmodeller med viss erfarenhet av infektionsbiologi, eller etablerade virologer som har arbetat omfattande med komplexa 3D-vävnadsmodeller, med stöd av en publikationslista som speglar expertis inom ett eller båda dessa områden.
Vad erbjuder vi?
En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Laboratoriet för systemvirologi erbjuder en unik tvärvetenskaplig utbildningsmiljö där en postdoktorand kan utveckla en hybrid vetenskaplig identitet som spänner över både praktiska laboratorieförsök och datadriven, kvantitativ analys. Laboratoriet integrerar storskaliga metoder såsom transkriptomik, proteomik, metabolomik och nätverksbiologi för att förstå hur virus omformar värdcellssystem på en global nivå.

Detta innebär att du som postdoktor kommer att få tillgång till banbrytande multi-omik-tekniker och, i allt högre grad, till beräkningsverktyg och bioinformatikpipelines som är högt värderade inom både akademin och industrin. Arbetet med humana organoider tillför ytterligare en dimension av translationell relevans, eftersom resultaten är direkt tillämpliga för att förstå mänskliga sjukdomar snarare än att vara begränsade till djurmodeller eller förenklade cellinjer. Kombinationen av komplex vävnadsmodellering och analys på systemnivå placerar dig i främsta ledet inom infektionsbiologi, vilket gör din profil konkurrenskraftig för självständiga forskartjänster, anslag och samarbeten.

Utöver den tekniska utbildningen tenderar en miljö inom systemvirologi att främja en kultur av integrerat tänkande, där du lär dig att koppla molekylära mekanismer till resultat på vävnads- och organismnivå, en färdighet som blir alltmer sällsynt och eftertraktad. Den aktuella tjänsten erbjuder chansen att bygga upp en vetenskapligt distinkt profil i skärningspunkten mellan virologi, stamcellsbiologi och systembiologi, vilket öppnar dörrar långt bortom den traditionella karriärvägen inom virologi.

Placering: Flemingsberg

Läs om systemvirologilabbet (eng)
Ansökan
Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

• Bevis om doktorsexamen
• Ett komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
• En komplett publikationslista
• En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.
Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss!