Doktorandplats i medicinsk vetenskap

Göteborgs universitet möter samhällets utmaningar med mångsidig kunskap. 56 000 studenter och 6 600 medarbetare gör universitetet till en stor och inspirerande arbetsplats. Stark forskning och attraktiva utbildningar lockar forskare och studenter från hela världen. Med ny kunskap och nya perspektiv bidrar Göteborgs universitet till en bättre framtid.Doktorandplats i medicinsk vetenskap Till Göteborgs universitet, Sahlgrenska akademin, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för laboratoriemedicin, söker vi en doktorand inom DDLS-området Datadriven precisionsmedicin och diagnostik Datadriven livsvetenskap (DDLS) använder data, beräkningsmetoder och artificiell intelligens för att studera biologiska system och processer på alla nivåer, från molekylära strukturer och cellulära processer till människans hälsa och de globala ekosystemen. SciLifeLab och Wallenbergs nationella program för datadriven livsvetenskap  (DDLS) har som mål att rekrytera och utbilda nästa generations forskare inom datadriven livsvetenskap och skapa globalt ledande kompetens inom beräknings- och datavetenskap för livsvetenskap i Sverige. Programmet har 3,1 miljarder SEK i finansiering (ca 290 MUSD) under 12 år från Knut och Alice Wallenbergs stiftelse. Under 2024 kommer DDLS forskarskola att lanseras via rekryteringen av 20 akademiska- och 7 industridoktorander. Under programmets gång kommer mer än 260 doktorander och 200 postdoktorer att vara en del av forskarskolan. DDLS-programmet har fyra strategiska forskningsområden: Datadriven precisionsmedicin och diagnostik, Datadriven smittspridning och infektionsbiologi, Datadriven cell- och molekylärbiologi samt Datadriven evolution och biodiversitet. För mer information, se https://www.scilifelab.se/data-driven/ddls-research-school/  Området Datadriven precisionsmedicin och diagnostik omfattar dataintegration, analys, visualisering och datatolkning för patientstratifiering, upptäckt av biomarkörer för sjukdomsrisker, diagnos, läkemedelsrespons och övervakning av hälsa. Forskning inom precisionsmedicin förväntas använda befintliga starka tillgångar i Sverige och utomlands, såsom molekylära data (t.ex. omics), avbildningstekniker, elektroniska hälso- och sjukvårdsdata, longitudinella patient- och befolkningsregister och biobanker. Arbetsuppgifter    Titel på projektet: Mot precisionsmedicin för ischemisk stroke: Integrering av klinisk, molekylär omik och neuroimaging data med hjälp av maskininlärning  Projekt: Stroke är en av de vanligaste orsakerna till död och funktionsnedsättning hos vuxna. Stroke är heterogen både vad gäller etiologi och utfall. Många strokeöverlevare drabbas av en ny (rekurrent) stroke som har högre dödlighet och större risk för funktionsnedsättning jämfört med förstagångsstroke. Således finns det stort behov av förbättrad sekundärprevention. I dagsläget är dock många av de molekylära mekanismerna bakom rekurrent stroke och bestående funktionsnedsättning fortfarande okända. Det övergripande syftet med detta doktorandprojekt inom datadriven livsvetenskap (DDLS) är att använda artificiell intelligens (AI) metoder, särskilt djup och maskininlärning (ML), för att förbättra mekanistisk förståelse och prediktion av utfall efter ischemisk stroke. På sikt kommer detta projekt att bidra till utvecklingen av precisionsmedicin för stroke.  Det finns två huvudsakliga delprojekt. Det första baseras på integrering av molekylär omik (protein och RNA) data. Doktoranden kommer här att söka blodbaserade biomarkörer som är associerade med rekurrent stroke (syfte 1) och funktionellt och neurologiskt utfall (syfte 2) med hjälp av ML-metoder. De mest lovande molekylära biomarkörerna kommer därefter att testas för prediktiv prestanda. Det andra delprojektet kommer innefatta analys av bildundersökningar. Doktoranden kommer att implementera en AI-baserad ”pipeline” för att extrahera olika mätvärden från magnetkameraundersökningar av hjärnan. Detta kommer att innefatta ett forskningsbesök till Resilient Brain Lab vid Massachusetts General Hospital, Boston, USA. Den prediktiva prestandan hos de radiomiska biomarkörerna kommer att testas enskilt och i kombination med de molekylära biomarkörerna (syfte 3).  Handledningsteamet består av fyra forskare med kompletterande kompetens inom områden såsom klinisk strokeforskning, genetik, molekylärbiologi, bioinformatik och AI. Vi har breda nationella och internationella samarbeten vilket säkerställer att doktoranden snabbt kommer i kontakt med ett brett nätverk av forskare och kommer att befinna sig i en stimulerande och interaktiv miljö. Eftersom vi verkar i en internationell miljö är det en förutsättning att doktoranden har utmärkt kommunikationsförmåga skriftligt och verbalt på engelska. Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet, god organisationsförmåga, förmåga att arbeta självständigt inom överenskomna ramar och förmåga att arbeta i ett team, liksom att ha en vilja att lära sig nya metoder och färdigheter.  För mer info var god se: https://www.gu.se/en/research/christina-jern Kontaktuppgifter för anställningen    Har du frågor om projektet är du välkommen att kontakta huvudhandledaren, Christina Jern, professor, Institutionen för biomedicin,  telefon: 0709-831616, e-post: christina.jern@neuro.gu.se  eller biträdande handledare Tara Stanne, docent, Institutionen för biomedicin,  telefon: 0707-927047 e-post: tara.stanne@gu.se  Ansökan    För ytterligare information och för att söka platsen se den fullständiga annonsen på https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/lediga-anstallningar      Ansökan ska vara inkommen senast: 2024-06-09 Universitetet arbetar aktivt för en arbetsmiljö med jämställda förhållanden och sätter värde på de kvalitéer mångfald tillför verksamheten. Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Enligt Riksarkivets föreskrifter är universitetet skyldigt att förvara ansökningshandlingar i två år efter tillsättningsbeslutet. Om du som sökande till en anställning särskilt begär tillbaka dina handlingar återsänds de när de två åren har förflutit, i annat fall kommer de att gallras ut. Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Göteborgs universitet anlitar upphandlad annonsbyrå i samband med rekrytering av personal. Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av jobbannonser.