Two postdoc postions - one computational and one wet lab – in Hypoxia Biology and Genome Regulation

Om jobbet

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?
Kom och bli en del av Kragesteens grupp vid institutionen för Medicinsk Biokemi och Biofysik (MBB) på Karolinska Institutet/Biomedicum och var med och kartlägg den molekylära logiken bakom syrehomeostas - central för människans hälsa - med förstklassiga faciliteter, passionerade biomedicinska forskare, en pulserande huvudstad och natursköna miljöer runt hörnet.

Syrehomeostas är avgörande för människans överlevnad, men hur syre känns av, regleras och kodas på genomnivå i olika celltyper är ännu oklart. Centralt i detta system är Norn-cellerna - en sällsynt, fibroblastlik celltyp i njuren som vi nyligen upptäckte och molekylärt definierade som den exklusiva källan till erytropoietin (EPO), hormonet som styr produktionen av röda blodkroppar och därmed kroppens syretillförsel. Norn-celler fungerar som en viktig syresensor som kopplar vävnadshypoxi till systemiska svar. De genreglerande mekanismer som styr Norn-cellernas funktion - och därigenom syrehomeostas - är dock outforskade eftersom cellerna är få, svåråtkomliga och humana modellsystem saknas.

Kragesteen-gruppen utvecklar humana njur-organoidmodeller för reglering av röda blodkroppar och använder hypoximodeller i mus ihop med genomredigering och single-cell-omik för att kartlägga och manipulera syresensorns kretsar. Genom att avslöja den molekylära logiken bakom syresensorik, med fokus på Norn-celler och tibetansk hypoxianpassning, kommer du att etablera ett nytt ramverk för hur genom upprätthåller systemiska syrenivåer och anpassar sig till varierande miljöer. Arbetet syftar till att avslöja grundläggande principer för homeostas och skapa nya möjligheter för behandling av hypoxirelaterade sjukdomar såsom kronisk njursjukdom och anemi.
Din roll
Vi söker mycket motiverade och entusiastiska postdoktorer med ett starkt intresse för utvecklingsbiologi, genomreglering och enkelcells-teknologier för att studera de molekylära mekanismerna bakom syrehomeostas och mänsklig fysiologisk anpassning.
Wet lab-postdoktor
Huvudsakliga arbetsuppgifter:

• iPSC-odling och utveckling av 3D-modeller av njurutveckling
• CRISPR-baserad genom- och epigenomredigering (iPSC/mus)
• Hypoxistudier i musmodeller
• Flödescytometri, mikroskopi och andra molekylärbiologiska metoder
• Användning av avancerade single-cell-, multimodala och spatiala epigenomteknologier
• Presentation av resultat internt och internationellt samt publicering i vetenskapliga tidskrifter
• Handledning av master- och doktorandprojekt
• Författande av rapporter, manuskript och dokumentation

Computational postdoktor
Huvudsakliga arbetsuppgifter:

• Rutinanalys och integration av single-cell- och spatiala multiomik-datasätt
• Enhancer-gen-kopplingar / genetiska regulatoriska nätverk / cis-regulatorisk grammatik
• Koppling av transkriptionsfaktorer till specifika regulatoriska element
• Sekvens- och kromatinbaserade modeller (foundation models, multimodal deep learning, sequence2function-modeller)
• Analys och integration av tibetanska populationsgenetikdata och andra evolutionära datasätt
• Presentation av resultat internt och internationellt samt publicering i vetenskapliga tidskrifter
• Handledning av master- och doktorandprojekt
• Författande av rapporter, manuskript och dokumentation

Vem är du?
För anställning som postdoktor krävs en doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara en doktorsexamen. Kravet ska vara uppfyllt senast vid anställningsbeslutet. Det är meriterande om doktorsexamen har avlagts inom de senaste tre åren, men kan vara äldre vid särskilda skäl.

Vi välkomnar sökande med doktorsexamen i molekylärbiologi, biomedicin, computational biology, bioinformatik eller angränsande områden. Den framgångsrika kandidaten är en nyfiken, motiverad och ansvarstagande forskare med god kommunikations- och organisationsförmåga som trivs med att arbeta tillsammans med andra och värdesätter hög kvalitet i sitt arbete.

Arbetet kräver:

• Expertis inom molekylärbiologiska tekniker inklusive cellodling
• Erfarenhet av musmodeller, humana iPSC, organoider, genomredigering och sc-omik är meriterande
• Expertis inom computational biology och dataanalys i R/Python eller liknande
• Erfarenhet av single-cell multiomik är meriterande
• Erfarenhet av populationsgenetik är meriterande
• Goda kunskaper i engelska och utmärkta kommunikativa färdigheter

Personlig lämplighet är av stor betydelse och du förväntas passa väl in i en internationell och tvärvetenskaplig forskningsmiljö.
Vad erbjuder vi?
En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Placering: Solna
Ansökan
Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

• Bevis om doktorsexamen
• Ett komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
• En komplett publikationslista
• En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)

Välkommen med din ansökan senast den7 april 2026
Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.
Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss!