Postdoktoral forskare inom genetisk ödeskartläggning av hematopoetiska stamceller

Om jobbet

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?
Vi söker en mycket motiverad och skicklig postdoktoral forskare som vill ta ledningen i ett eller flera utmanande forskningsprojekt i professor Sten Eirik W. Jacobsens forskargrupp.Forskningsprojektet/projekten fokuserar på genetisk ödeskartläggning av normala mus- och humana hematopoetiska stamceller (HSCs), med användning av DNA-mutationer för klonal härstamningsspårning av HSCs. Forskningen finansieras genom befintliga anslag, bland annat från Vetenskapsrådet, Cancerfonden och Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse.
Forskningsinriktning och projekt
En huvudlinje i Jacobsens forskargrupp är att förstå de differentieringsvägar som styr hur hematopoetiska stamceller (HSCs) utvecklas till mogna blodceller (referenser 1-7). Detta studeras i genetiska musmodeller, hos friska människor samt vid myeloida maligniteter. Centrala tekniker som används i dessa studier inkluderar genetisk/mutational klonal ödeskartläggning, flödescytometri samt olika in vitro- och in vivo-stamcellsanalyser.

De projekt som den nya postdoktorn främst kommer att arbeta med, kommer att använda samma typ av DNA-sekvenseringsanalys som i en nyligen publicerad studie där vi retrospektivt (genom fylogenetisk analys) kartlade humana HSC:s utvecklingslinjer (7).

Projekten kommer delvis att bedrivas vidCenter for Hematology and Regenerative Medicine (HERM)och delvis vidInstitutionen för cell- och molekylärbiologi (CMB). Jacobsens laboratorium har starka pågående samarbeten kopplade till dessa projekt, både vid Karolinska Institutet och internationellt. Den rekryterade postdoktorn kommer att gynnas av interaktioner inom ett mycket samarbetsinriktat nätverk.
Ansvarsområden
Medlemmar i forskargruppen och samarbetspartners kommer att ha nära och regelbundna kontakter kring dessa forskningsprojekt. Viktiga tekniker som används i dessa studier inkluderar avancerad flödescytometri, helgenomsekvensering av DNA (inklusive klonala analyser), samt olika in vitro- och in vivo-assays.

Den som innehar tjänsten bör trivas med att arbeta i team och kunna samarbeta väl med andra - både inom gruppen och med externa forskare. Goda kunskaper i engelska, både i tal och skrift, krävs för regelbundna presentationer av data och projektplaner.
Kvalifikationskrav

• Doktorsexamen. Företräde ges till sökande som erhållit doktorsexamen eller motsvarande forskarkompetens högst fem år före sista ansökningsdag för denna postdoktorala tjänst.
• Erfarenhet av avancerad DNA-sekvenseringsanalys, inklusive:
  - Goda kunskaper i programmering (t.ex. bash, Python, R) och arbete i Unix/Linux-miljöer
  - Erfarenhet av bioinformatiska pipelines för DNA-sekvenseringsdata (t.ex. variantidentifiering, kvalitetskontroll, databehandling)
• Stark vetenskaplig meritlista, dokumenterad genom en eller flera publikationer med hög genomslagskraft inom genetik, gärna med tillämpning på klonal spårning
• Utbildning i internationellt ledande laboratorier
• Goda kunskaper i engelska, både muntligt och skriftligt
• Förmåga att hålla sig uppdaterad inom det relevanta forskningsområdet

Vad erbjuder vi?
En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Placering: Flemingsberg och Solna

Blodets stamceller, hos friska och sjuka - Sten Eirik W. Jacobsen forskargrupp | Karolinska Institutet

Department of Cell and Molecular Biology | Karolinska Institutet

Center for Hematology and Regenerative Medicine (HERM)

Tio skäl att välja Karolinska Institutet

Ansökan
Ansökan ska innehålla följande dokument på engelska eller svenska:

• Ett personligt brev (max 1 sida) som sammanfattar din motivation för tjänsten, tidigare erfarenheter och forskningsintressen.
• En fullständig meritförteckning (CV) med nuvarande och tidigare anställningar.
• En komplett publikationslista där eventuella delade författarskap tydligt framgår.
• Namn och kontaktuppgifter till tre referenspersoner som känner till den sökandes senaste forskning och utbildning.

Ansökan lämnas via rekryteringssystemetVarbi.

I enlighet med Riksarkivets föreskrifter bevaras ansökningshandlingar i två år efter att anställningen vunnit laga kraft. Föreskrifterna gäller inte bilagor som tryckts eller på annat sätt publicerats.

Karolinska Institutet strävar efter att erbjuda en arbetsplats med en jämn könsfördelning, fri från diskriminering och med lika möjligheter för alla.

Referenser

Sanjuan-Pla A., et al., Platelet-biased stem cells reside at the apex of the haematopoietic stem-cell hierarchy. Nature, 2013. 502(7470): p. 232-236.

Woll PS et al., Myelodysplastic syndromes are propagated by rare and distinct human cancer stem cells in vivo . Cancer Cell, 2014. 25(6): p. 794-808.

Giustacchini A. et al., Single-cell transcriptomics uncovers distinct molecular signatures of stem cells in chronic myeloid leukemia. Nature Medicine, 2017. 23(6): p. 692-702.

Carrelha J., et al., Hierarchically related lineage-restricted fates of multipotent haematopoietic stem cells. Nature, 2018. 554(7690): p. 106-111.

Carrelha J., et al., Alternative platelet replenishment pathways initiated by distinct stem cells. Nature Immunology, 2024. 25(6): p. 1007-1019.

Dimitriou M., et al., Identification and surveillance of rare relapse-initiating stem cells during complete remission after transplantation . Blood, 2024. 143(11): p. 953-966.

Yoshizato T. et al., Stable contribution of lineage-restricted stem cells to steady-state human haematopoiesis. Nature Genetics, 2025. Doi: https://doi.org/10.1038/s41588-025-02405-w.

Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss!