Postdoktor inom Experimentell systemneurovetenskap och viral ingenjörskonst

Om jobbet

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?
Stagkourakis ochNyberg-grupperna, verksamma i toppmoderna forskningsmiljöer i gränslandet mellan Karolinska Institutet (KI) och SciLifeLab i Stockholm, rekryterar nu enpostdoktortill ett tvärvetenskapligt projekt med titeln Fast, Light-And-State-gated, Retro-Orbital AAVs to Tag & Control Neural Ensembles . Projektet leds gemensamt avStefanos StagkourakisochWilliam Nybergoch finansieras genom KI research incubator(KIRI).

Stagkourakis-gruppen är placerad vid Institutionen för neurovetenskap vid Karolinska Institutet och är en del av SciLifeLab, ett svenskt nationellt centrum för storskalig molekylär biovetenskap och avancerad forskningsinfrastruktur. Vår forskning fokuserar på de neurala mekanismer som styr grundläggande beteenden, såsom aggression, försvarsbeteenden och föräldrabeteende, med hjälp av avancerade beteendeparadigm, in vivo-registreringar och kretsmanipulationer.

Nyberg-gruppen, verksam vid Institutionen för medicin, Huddinge, och SciLifeLab, utvecklar evolverade AAV-kapsider samt tillstånds- och ljusstyrda genuttryckssystem för viral ingenjörskonst in vivo. Detta projekt sammanför de två grupperna för att bygga en gemensam experimentell plattform som ingen av laboratorierna skulle kunna etablera på egen hand.

Postdoktorn kommer att vara huvudsakligen baserad iStagkourakis-gruppenför det dagliga experimentella arbetet, men kommer att varafullt integrerad i båda forskningsmiljöerna, med strukturerad gemensam handledning från Nyberg och regelbunden närvaro i båda grupperna. För mer information om Stagkourakis-gruppen, se här, och om Nyberg-gruppense här.

Avdelning

Institutionen för neurovetenskap vid Karolinska Institutet omfattar cirka 20 forskargrupper som arbetar med grundläggande och sjukdomsrelaterade aspekter av nervsystemets funktion:https://ki.se/en/neuro/research/group-leaders-at-the-department-of-neuroscience

Tjänsten är en del av ett långsiktigt tvärvetenskapligt samarbete med Dr William Nyberg, biträdande lektor vid Institutionen för medicin, Huddinge, och SciLifeLab, vars forskargrupp utvecklar evolverade AAV-kapsider samt ljusstyrda genuttryckssystem för viral ingenjörskonst in vivo. Den utvalda kandidaten kommer att bidra till att vidareutveckla och konsolidera denna gemensamma forskningsplattform.
Din roll
Du kommer att vara huvudansvarig experimentell postdoktor i ett projekt i gränslandet mellan viral ingenjörskonst och systemneurovetenskap. Dina huvudsakliga arbetsuppgifter kommer att omfatta:

• Utveckling och implementering av ett dual-AAV-system för rödljus- och aktivitetsberoende transgenuttryck i vuxen mushjärna (utformning och testning i nära samarbete med Nyberg-gruppen).
• Genomförande av retro-orbitala AAV-injektioner, stereotaktiska kirurgier samt implantation av optiska fibrer/GRIN-linser.
• Design och genomförande av beteendeexperiment, med särskilt fokus på resident-intruder-paradigmet och relaterade instinktiva beteenden.
• Registrering av neural aktivitet med miniskop-avbildning eller tvåfotonmikroskopi (huvudfixerade och fritt rörliga förberedelser), samt kombination av detta med optogenetiska manipulationer.
• Samordning av viral produktion och testning tillsammans med Nyberg-gruppen samt etablering av robusta gemensamma SOP:er för verktygsplattformen.
• Analys av experimentella data med befintliga analysflöden (Python/MATLAB) samt samverkan med beräkningsinriktade kollegor för mer avancerade tillstånds- och nätverksanalyser.
• Spridning av forskningsresultat genom vetenskapliga manuskript, konferenspresentationer och interna seminarier, samt medverkan i handledning av studenter och forskningsassistenter vid behov.

Tjänsten är grundläggande integrativ: ditt arbete kommer att verka över båda laboratoriernas styrkeområden och bidra till att utveckla en sammanhållen forskningspipeline som spänner från viral design till systemnivåanalys av neurala kretsar.
Kvalifikationer
Vi söker en nyfiken, praktiskt lagd experimentell forskare som trivs med att arbeta metod- och disciplinöverskridande.

• Doktorsexamen (eller motsvarande) inom neurovetenskap, biomedicinska vetenskaper, bioengineering eller närliggande område, erhållen högst några år före planerad start (i enlighet med KI:s regler för postdoktorer).
• Stark erfarenhet av in vivo-experiment i gnagare, med kompetens inom minst ett av följande områden:
  • o Stereotaktisk kirurgi och viral/genetisk leverans
  • o In vivo-avbildning (miniskop, tvåfotonmikroskopi)
  • o Optogenetik/kemogenetik i beteendeexperiment
• Erfarenhet av design och genomförande av beteendeparadigm i mus.
• Dokumenterad vetenskaplig produktivitet, vanligen genom förstaförfattarartiklar eller motsvarande forskningsresultat.
• Hög grad av självständighet, god organisationsförmåga samt mycket god förmåga att kommunicera på engelska, både muntligt och skriftligt.
• God social kompetens och förmåga att arbeta både självständigt och i team - egenskaper som är centrala för denna roll.

Meriterande erfarenheter
Sökande med dokumenterad erfarenhet inom ett eller flera av följande områden uppmuntras särskilt att söka:

• AAV- eller lentiviralt arbete (design, framställning eller in vivo-användning).
• Kombination av beteendeexperiment med avbildning och/eller optogenetik i mus.
• Utveckling av skräddarsydda beteendeuppgifter och closed-loop-experimentella upplägg.
• Grundläggande färdigheter i dataanalys med Python eller MATLAB (mer avancerad modellering stöds av samarbetspartners).
• Tidigare deltagande i tvärvetenskapliga och samarbetsinriktade forskningsprojekt.

Framför allt värdesätter vi entusiasm för att lära sig nya tekniker, förmåga att felsöka och lösa komplexa experimentella problem samt ett genuint intresse för att förstå hur överlevnadskretsar i hjärnan är organiserade och kontrollerade.
Vem är du?
För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara en svensk doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.
Vad erbjuder vi?
En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Du kommer att ha en gemensam handledningsstruktur, där du är huvudsakligen placerad i Stagkourakis-gruppen (beteende, avbildning, systemneurovetenskap) och samtidigt erhåller samhandledning från Nyberg-gruppen (AAV-ingenjörskonst och optogenetisk kontroll av genuttryck).

Du får tillgång till:

• Fullt utrustade beteenderum och djuranläggningar (KM-B/KM-F).
• Tvåfotonmikroskop med SLM-modul, Inscopix-miniskop samt optiska fibersystem.
• AAV-produktion och reningsinfrastruktur samt molekylärbiologiska faciliteter via Nyberg-gruppen och SciLifeLab.
• Praktisk, kontinuerlig on-the-job-utbildning i vetenskapliga och tekniska färdigheter, samt handledning i att skriva vetenskapliga artiklar och forskningsansökningar, presentera data (föredrag och posters), handleda studenter och samordna samarbetsprojekt.

Du blir även en del av de bredare forskningsgemenskaperna inom KI Neurovetenskap och SciLifeLab, med möjlighet att delta i seminarier, workshops och kurser inom forskningsledning, etik och datahantering. Som postdoktor i detta projekt kommer du att ingå i KIRI - Karolinska Institutet Research Incubator, ett unikt initiativ vid KI som syftar till att bygga en stark miljö för tvärvetenskaplig forskning och banbrytande upptäckter.

Du kommer att ha tillgång till två projektledare (PIs) som du kan interagera med regelbundet för att underlätta forskningsprocessen och maximera de synergistiska effekterna av samarbetet. Du får även möjlighet att träffa andra KIRI-postdoktorer, presentera ditt arbete vid vetenskapliga evenemang och delta i KIRI:s aktiviteter.

Läs mer om KIRI här:
https://ki.se/en/research/research-areas-centres-and-networks/research-networks-at-ki/ki-research-incubator-kiri

Placering: Solna

Tjänsten är placerad vid Karolinska Institutet, Solna campus, med det huvudsakliga experimentella arbetet förlagt till Biomedicum, Institutionen för neurovetenskap, Solnavägen 9, 171 65 Solna, samt SciLifeLab Gamma 5, Tomtebodavägen 23, 171 65 Solna.

Besök och gemensamma arbetstillfällen kommer även att ske i Nyberg-gruppen (Institutionen för medicin, Huddinge, och SciLifeLab).

Anställningsform

Tjänsten är en heltidsanställning som postdoktor och finansieras genom KIRI-Fellow postdoktorprojektbidraget under en period om två år, med möjlighet till förlängning beroende på prestation och tillgänglig finansiering.

Anställningsvillkoren följer lokalt kollektivavtal för postdoktorer vid Karolinska Institutet.
Ansökan
Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

• Bevis om doktorsexamen
• Ett komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
• En komplett publikationslista
• Personligt brev (1-2 sidor) där du beskriver:
  - Dina forskningsintressen och hur de relaterar till det aktuella projektet
  - Din relevanta experimentella erfarenhet
  - Din motivation för att arbeta i Stagkourakis- och Nyberg-grupperna
• En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)
• Kontaktuppgifter till minst två referenspersoner (eller referensbrev, om sådana finns tillgängliga).

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.
Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss!