MSCA Doktorandplats i medicinsk vetenskap - Molekylär diagnostik för infektionssjukdomar

Om jobbet

Göteborgs universitet möter samhällets utmaningar med mångsidig kunskap. 58 000 studenter och 6800 medarbetare gör universitetet till en stor och inspirerande arbetsplats. Stark forskning och attraktiva utbildningar lockar forskare och studenter från hela världen. Med ny kunskap och nya perspektiv bidrar Göteborgs universitet till en bättre framtid.

Doktorandplatsi medicinsk vetenskap

Titel på projektet: Molekylära verktyg för att förbättra diagnostik av infektionssjukdomar

Avdelningen för infektionssjukdomar finns vid Institutionen för biomedicin vid den Medicinska fakulteten Sahlgrenska akademin vid Göteborgs universitet.

Universitetsgemensam information om vad det innebär att vara doktorand vid Göteborgs universitet kan du finna på universitetets doktorandsidor https://www.gu.se/utbildning-till-att-bli-forskare

Arbetsuppgifter

Utbildning i medicinsk vetenskap består i att genomföra ett vetenskapligt projekt och att delta i kurser på forskarnivå om minst 30 högskolepoäng. Utbildningen avslutas med att doktoranden skriver en vetenskaplig sammanläggningsavhandling eller en monografi motsvarande minst 120 högskolepoäng. För mer information om utbildning på forskarnivå vid Sahlgrenska akademin se https://www.gu.se/sahlgrenska-akademin/var-forskarutbildning

Projekt: Antibiotikaresistens förblir ett av de allvarligaste hoten mot global hälsa, och orsakar över 100 000 dödsfall världen över varje år samt ger upphov till direkta och indirekta ekonomiska konsekvenser i miljardklassen. Endast i Europa uppskattas årligen 25 000 dödsfall tillskrivas resistenta bakterieinfektioner. Spridningen av AMR drivs av felaktig och överdriven användning av antibiotika, men också av förändrade samhälls- och miljöförhållanden - inklusive frekvent resande, klimatförändringar och åldrande befolkning. Konventionell odlingsbaserad diagnostik, även om den är tillförlitlig, är långsam och ger kanske inte alltid snabba och tillräcklig information för kritiska kliniska beslut, särskilt inom akut- och sjukvård. Att minska diagnostikens svarstid och öka upplösningen för patogenidentifiering och resistensprofilering är avgörande för att minimera dödlighet, lidande och vårdkostnader. Därför är nya metoder - baserade på molekylär och strukturell biologi, högupplöst masspektrometri, samt bioinformatik högst nödvändiga.

Huvudmålet med detta doktorandprojekt är att främja den kliniska diagnostiken av infektionssjukdomar genom att utveckla molekylära verktyg och biosensorteknologier som kan upptäcka bakteriella patogener och antimikrobiell resistens direkt från patientprover. Detta arbete syftar till att påskynda identifieringen och karakteriseringen av viktiga biomarkörer med hjälp av genomik, masspektrometri-baserad proteomik och bioinformatik.

Vi söker nu en kandidat med relevant bakgrund inom ämnesområdet, exempelvis erfarenhet av bakteriella patogener i riskgrupp 2 (odling, isolering och säker hantering), plus molekylärbiologiska färdigheter inom genomik och proteomik, inklusive optimerad DNA-extraktion för NGS och arbetsflöden för peptid- och proteinbaserad proteotypning. Därutöver är erfarenhet av bakteriell genomsekvensering med olika plattformar, nedströms sammansättning av genom och annotering meriterande, liksom integration av masspektrometribaserade peptiddata med genomsekvenser för att identifiera biomarkörer för antimikrobiell resistens och virulens.

Doktoranden kommer att arbeta hos Roger Karlssons grupp vid Göteborgs universitet (UGOT), Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar, och i nära samarbete med doktorander i BUG-ID-projektet samt med läkare vid Sahlgrenska universitetssjukhuset, avdelningen för klinisk mikrobiologi. Den metod som valts för att studera ytan på patogener är Lipidbaserad proteinimmobilisering (LPI) (utvecklad av Nanoxis Consulting AB), vilken framgångsrikt har använts för att utföra ytrakning av intakta bakterier. Efter bioinformatisk validering kommer artspecifika peptidmarkörer att användas för att funktionalisera grafensensorerna i BUG-ID projektet.

För mer information se https://www.gu.se/en/research/roger-karlsson

Forskarutbildning omfattar fyra års heltidsstudier och leder fram till en doktorsexamen.

Behörighet

För tillträde till forskarutbildning på forskarnivå krävs grundläggande och i förekommande fall den särskilda behörighet som är fastställd i den allmänna studieplanen för forskarutbildningsämnet.

Grundläggande behörighet till forskarutbildning på forskarnivå har den som:

1. avlagt examen på avancerad nivå, eller
2. fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
3. på annat sätt inom eller utom landet förvärvat motsvarande kunskaper.

Särskild behörighet till forskarutbildning i medicinsk vetenskap har den som:

med godkänt resultat fullgjort kurs engelska B/6 eller bedöms ha förvärvat motsvarande kunskaper genom tidigare studier.

Bedömningsgrund

Urval bland sökande som uppfyller krav på grundläggande och särskild behörighet baseras på förmågan att tillgodogöra sig forskarutbildningen. Vid bedömningen fästs särskild vikt vid dokumenterade kvalifikationer avseende:

- specifika kunskaper och färdigheter inom ämnesområdet och närliggande forskningsområden
- erfarenhet av vetenskaplig teori och relevanta forskningsmetoder
- vetenskaplig analys och presentation styrkt genom uppsats, examensarbete, vetenskapliga publikationer eller liknande.

Antagning och anställning

Efter du har blivit antagen till forskarutbildning kommer du att erhålla en doktorandanställning vid Göteborgs universitet. Bestämmelser för anställning som doktorand återfinns i förordning SFS 1993:100. Den första anställningen som doktorand får gälla högst ett år och får förnyas med högst två år i taget. En doktorand får som längst vara anställd som doktorand under åtta år men den sammanlagda anställningstiden får inte vara längre än vad som motsvarar utbildning på forskarnivå på heltid under fyra år.

Anställningen är en MSCA doktorandanställning inom ett Marie Skłodowska Curie program med MSCA finansiering. För att bli beviljad MSCA finansiering ska sökande, vid ansökningstillfället, ej ha vistats i Sverige för studier eller arbete längre än 12 månader under de senaste 3 åren. Den sökande får ej heller ha arbetat med forskning mer än 4 år efter sin mastersexamen (motsvarande heltid forskningserfarenhet) och inte heller disputerat inom något annat område. Doktorander som anställs genom Marie Sklodowska-Curie-programmet kommer att erhålla lön i enlighet med Marie Curie-reglerna för doktorander under stipendiets löptid (36 månader). Detta innebär att bruttolönen (dvs. efter avdrag för arbetsgivaravgifter men inklusive arbetstagarens skatter) är ca (beroende på växelkurs) 34 000 SEK/månad (exklusive eventuellt familjetillägg). Under återstående tid av studierna kommer doktoranden att vara anställd enligt ett vanligt doktorandkontrakt, enligt den överenskomna lönestegen för doktorander.

Placering: Sahlgrenska akademin, Institutionen för biomedicin, avdelningen infektionssjukdomar. Omfattning 100%. Tillträde enligt överenskommelse.

Universitetet tillämpar lokalt avtal om lönesättning av doktorander.

Forskarutbildningen vid Institutionen för biomedicin kräver fysisk närvaro för att genomföra studierna. Om den som antas behöver uppehållstillstånd för att bedriva studier i Sverige, har Institutionen för biomedicin rätt att återkalla beslut om antagning i det fall den antagne inte kan uppvisa ett giltigt uppehållstillstånd vid datumet för studiestart.

Kontaktuppgifter för doktorandplatsen

Har du frågor om projektet är du välkommen att kontakta huvudhandledaren,
Roger Karlsson, docent, Institutionen för biomedicin
e-post: roger.karlsson@gu.se

Fackliga organisationer

Fackliga företrädare vid Göteborgs universitet hittar du här:
https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/hjalp-for-sokande

Ansökan

Du ansöker om att bli antagen till forskarutbildning via Göteborgs universitets rekryteringsportal. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Komplett ansökan innehåller i pdf format:

• Personligt brev
• CV
• Bevis om examen på avancerad nivå eller fullgjorda kurser, se behörighetskrav ovan
• Bevis om slutförd kurs i Engelska 6 eller motsvarande (gymnasiebetyg eller motsvarande)

För sökande med utländsk examen

Om examen är från lärosäte utanför Sverige eller inte har kontrollerats av en svensk myndighet tidigare är det viktigt att du bifogar diplom och ämnesförteckningar som underlättar bedömning.

Ange i din ansökan en kontakt (telefonnummer eller e-post) till utfärdande lärosäte som kan verifiera examen.

För information om hur det särskilda behörighetskravet i engelska kan uppfyllas, se https://www.universityadmissions.se/en/entry-requirements/english-language-requirements/

Ansökan ska vara inkommen senast:2026-02-19

Universitetet arbetar aktivt för en arbetsmiljö med jämställda förhållanden och sätter värde på de kvalitéer mångfald tillför verksamheten.

Universitetet tillämpar individuell lönesättning.

Enligt Riksarkivets föreskrifter är universitetet skyldigt att förvara ansökningshandlingar i två år efter tillsättningsbeslutet. Om du som sökande till en anställning särskilt begär tillbaka dina handlingar återsänds de när de två åren har förflutit, i annat fall kommer de att gallras ut.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Göteborgs universitet anlitar upphandlad annonsbyrå i samband med rekrytering av personal. Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av jobbannonser.