Forskningsspecialist – Translationell proteomik inom akut lymfatisk leukemi

Om jobbet

Vill du bidra till att förbättra människors hälsa?
Karolinska Institutet, Institutionen för Onkologi-Patologi, Lehtiö forskargrupp

VidInstitutionen för Onkologi-Patologibedrivs grundforskning, translationell och klinisk forskning samt utbildningsverksamhet inom cancerområdet. Cirka 300 personer från över 40 nationer arbetar för närvarande vid institutionen. Omkring 30 forskargrupper med olika profiler inom cancerforskning är verksamma här, och vi har omkring 110 doktorander. Institutionen för Onkologi-Patologi ansvarar för grundutbildningskurser i patologi, onkologi och rättsmedicin för läkarstudenter, samt kurser i tumörbiologi för biomedicinstudenter och patologikurser för optiker.

Lehtiö forskargrupp är en translationell forskargrupp med ett starkt driv att förbättra analysen av det mänskliga proteomet genom att utveckla nya metoder som kan tillämpas för att förbättra individanpassad cancerbehandling.
Ämnesbeskrivning
Tjänsten kommer att vara placerad iforskargruppen för cancerproteomik och masspektrometri, ledd av professor Janne Lehtiö vid Science for Life Laboratory (SciLifeLab). Karolinska Institutet är ett av de fyra grundande universiteten bakom SciLifeLab, som idag är en nationell infrastruktur och ett forskningscenter inom teknikdriven livsvetenskap.

Lehtiögruppen är en translationell forskargrupp med ett starkt driv att förbättra analysen av det mänskliga proteomet genom att utveckla nya metoder som kan användas för att förbättra individanpassad cancerbehandling.

För närvarande vill vi att stärka vårt leukemiforskarteam, lett av Dr. Rozbeh Jafari, med en framstående forskningsspecialist med dokumenterad expertis inom translationell leukemiproteomik och masspektrometribaserad multiomikanalys, med särskilt fokus på akut lymfatisk leukemi (ALL).

Anställningen är en tidsbegränsad tjänst på ett år. Vi erbjuder en mycket stimulerande och mångsidig arbetsmiljö i ett team av högt motiverade medarbetare med expertis inom avancerad teknologi.
Din roll
Vi söker en mycket motiverad forskningsspecialist med stark expertis inom translationell proteomik av akut lymfatisk leukemi (ALL) och masspektrometribaserad multiomikanalys, samt ett dokumenterat intresse för att förstå mekanismer bakom läkemedelsrespons och resistens i ALL. Den framgångsrika kandidaten kommer att spela en central roll i att designa, genomföra och tolka storskaliga proteomiska, fosfoproteomiska och protein-läkemedelsinteraktionsstudier i ALL, med särskilt fokus på antimetabolitbehandlingar, signaleringsnätverk och biomarkörupptäckt.
Arbetsuppgifter:

• Designa och utföra kvantitativa proteomik- och fosfoproteomikstudier i leukemicellinjer och primära patientprover med hjälp av avancerade LC-MS/MS-arbetsflöden.
• Använda termal proteomprofilering, inklusive Proteome Integral Solubility Alteration (PISA), CETSA och relaterade metoder, för att studera läkemedels-proteininteraktioner och verkningsmekanismer.
• Integrera läkemedelskänslighetsdata, proteomik, transkriptomik och kliniska data för att identifiera molekylära determinanter för terapeutiskt svar och resistens.
• Leda och utveckla projekt med fokus på verkningsmekanismer för cytotoxiska behandlingar i ALL, inklusive funktionella störningsexperiment (siRNA/shRNA) för att stödja mekanistiska fynd.
• Tillämpa och utveckla beräknings- och statistiska metoder för multiomikanalys, inklusive pathway-baserade och systembiologiska angreppssätt.
• Tolka komplexa dataset i ett biologiskt och translationellt sammanhang, och koppla molekylära fynd till leukemibiologi och klinisk relevans.
• Förbereda manuskript av hög kvalitet för publicering i peer review-granskade tidskrifter.
• Bidra till handledning och mentorskap av doktorander och postdoktorala forskare.
• Stödja ansökningar om forskningsanslag och bidra till nationella och internationella forskningssamarbeten.

Behörighetskrav
För anställning som forskningsspecialist vid Karolinska Institutet tillämpas de behörighetskrav som anges iRiktlinjer för andra anställningar än läraranställningar vid Karolinska Instituteti förhållande till fastställd anställningsprofil.

Behörig att anställas som forskningsspecialist är den som har uppvisat vetenskaplig skicklighet och har avlagt doktorsexamen eller har utländsk examen som bedöms motsvara svensk doktorsexamen samt har dokumenterat forskningsarbete efter disputation.
Bedömningsgrunder
Det är särskilt meriterande att den sökande har uppvisat

• Doktorsexamen (PhD) i cancerbiologi, systembiologi, proteomik eller en närliggande disciplin
• Flera års postdoktoral eller motsvarande forskningserfarenhet med fokus på akut lymfatisk leukemi (ALL)
• Stark vetenskaplig grund inom cancerbiologi med omfattande expertis i molekylära och cellulära biologiska tekniker relevanta för ALL-forskning
• Dokumenterad expertis inom masspektrometribaserad proteomik, inklusive kvantitativ proteomik och/eller fosfoproteomik
• Erfarenhet av termal proteomprofilering, såsom CETSA, TPP, PISA eller liknande metoder för target engagement
• Gedigen erfarenhet av läkemedelskänslighetstester och analys av farmakologiska responser
• Praktisk erfarenhet av funktionella perturbationsmetoder, inklusive siRNA- och/eller shRNA-baserad gendämpning
• Stark erfarenhet av integrering av multiomikdata, inklusive analys av läkemedelsrespons, transkriptomik och proteomik
• Dokumenterad kunskap om ALL-biologi och translationell leukemiforskning med cellinjer och kliniska prover
• Bevisad förmåga att självständigt driva komplexa forskningsprojekt från experimentell design till publikation
• Erfarenhet av att arbeta i tvärvetenskapliga forskningsmiljöer som förenar biologi, klinisk forskning och dataanalys
• Utmärkt kunskap i engelska, både i tal och skrift
• Starka kommunikativa färdigheter och förmåga att tydligt presentera komplexa resultat

Det är meriterande att den sökande har uppvisat

• Erfarenhet av att arbeta med ALL-cellinjer och primära ALL-patientprover
• Förtrogenhet med antimetabolitbehandlingar och mekanismer för cellulära stressresponser
• Erfarenhet av pathway-, nätverks- och systemnivåanalyser inom cancerforskning
• Kunskap om läkemedelsmetabolism, translationskontroll eller proteostasrelaterade signalvägar
• Erfarenhet av att bidra till eller samordna stora samarbeten inom proteomik eller multiomik
• Undervisnings- eller handledningserfarenhet inom proteomik, bioinformatik eller cancerbiologi
• Erfarenhet av att erhålla forskningsfinansiering i öppen konkurrens som huvud- eller medsökande

Eftersom tjänsten innebär nära samarbete med flera forskare inom olika områden läggs stor vikt vid personliga egenskaper såsom:

- Mycket god samarbetsförmåga

- Utmärkta kommunikations- och analytiska färdigheter

Det är utifrån en sammantagen helhetsbedömning av de sökandes meriter och skicklighet som Karolinska Institutet bedömer vilken av de sökande som har de bästa förutsättningarna att bidra till en positiv utveckling av verksamheten.
Vad erbjuder vi?
En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI träffar du forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Placering:Solna

Dr Rozbeh Jafaris forskningsteam
Tio skäl att välja Karolinska Institutet

Ansökan
Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska. Ansökan ska innehålla följande handlingar: Intyg om doktorsexamen, CV, meriter och beskrivning av planerad forskning som presenteras i enlighet medKarolinska Institutets meritportfölj.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. Ansök senast den 6 april.

Anställningen är en tidsbegränsad tjänst på ett år.
Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss!