Forskningsspecialist i encellig kromatingenomik

Om jobbet

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?
Institutionen för mikrobiologi, tumör- och cellbiologi (MTC) vid Karolinska Institutet bedriver forskning och undervisning inom immunologi, infektionsbiologi, cellbiologi och cancer. MTCs nyckelord är multidisciplinära, överbryggande, nationella och internationella samarbeten. Vårt laboratorium ligger påScience for Life Laboratorypå Karolinska Institutets campus i Solna. SciLifeLab är utrustat med toppmodern instrumentering och kärnfaciliteter, och är hem för ett av de största sekvenseringsklustren i Europa.

Vår grupp kombinerar experimentellt- och beräkningsarbete och syftar till att utveckla och tillämpa nya genomomfattande tekniker för att ta itu med grundläggande biologiska frågor med medicinska implikationer. Vi är särskilt intresserade av hur subtila variationer i genuttryck kan leda till differentiella cellulära fenotyper och vi brinner förRNA-biologi . Hos oss får du möjlighet att arbeta i en mycket tvärvetenskaplig och internationell miljö och kombinera utvecklingen av state-of-the-art genomomfattande tillvägagångssätt med molekylär dissektion av grundläggande biologiska problem.

Är du intresserad av att utveckla banbrytande genomomfattande teknologier för att undersöka reglering av genuttryck? Vill du reda ut hur vårt kromatin integrerar olika regleringssignaler på encellsnivå? Kom och följ med oss på SciLifeLab!
Ämnesbeskrivning
Genuttryck är en grundläggande process som styr cellulär identitet och plasticitet. Anmärkningsvärt nog förekommer heterogent genuttryck ofta inom isogena cellpopulationer. I samband med cancer leder detta ofta till uppkomsten av persisterande celler som kan undgå behandling. Att förstå den molekylära mekanismen som ligger till grund för denna mångfald, inklusive överhörningen mellan transkriptionsfaktorer, är avgörande för att förstå hur denna mångfald uppstår. Trots framväxten av många högupplösta tekniker under det senaste decenniet förstår vi fortfarande inte helt hur olika regleringssignaler integreras på kromatin- och encellsnivå. Att dekonvolvera denna komplexa överhörning har betydande potential att belysa vår grundläggande förståelse av genuttryck och låsa upp nya terapeutiska vägar inom cancer och därefter.
Din roll
Tjänsten som forskningsspecialist fokuserar på utveckling av innovativa genomövergripande metoder för att studera transkriptionsfaktorinteraktion på encellsnivå, och hur olika regulatoriska signaler integreras på kromatinnivå.

Som forskningsspecialist hos oss förväntas du leda teknikutveckling och datatolkning. Detta kommer att inkludera utveckling av nya genomiska teknologier och betydande bidrag till hypotesgenerering, biologisk tolkning och ortogonal validering. Du kommer att bedriva originalforskning, assistera i handledningen av juniora kollegor och förvärva de nödvändiga experimentella och beräkningsmässiga färdigheter som krävs för att projektet ska slutföras på ett framgångsrikt sätt. I rollen som forskningsspecialist förväntas du kommunicera vetenskapliga resultat genom att bidra till vetenskapliga publikationer och delta i relevanta möten. Ytterligare ansvarsområden inkluderar att stödja laboratorieledning och samordning, samt att bistå gruppledaren med administrativa uppgifter såsom ansökningsskrivning och vetenskaplig rapportering. Den ideala kandidaten kommer att delta i teamets allmänna arbetsuppgifter och kommunicera effektivt med forskare från olika bakgrunder i en mycket tvärvetenskaplig och internationell miljö. Arbetsspråket är engelska
Behörighetskrav
För anställning som forskningsspecialist vid Karolinska Institutet tillämpas de behörighetskrav som anges iRiktlinjer för andra anställningar än läraranställningar vid Karolinska Instituteti förhållande till fastställd anställningsprofil.

Behörig att anställas som forskningsspecialist är den som har uppvisat vetenskaplig skicklighet och har avlagt doktorsexamen eller har utländsk examen som bedöms motsvara svensk doktorsexamen samt dokumenterat forskningsarbete efter disputation.

Sökande till denna tjänst bör ha en doktorsexamen i molekylärbiologi, medicinska vetenskaper eller liknande område.

Krav för tjänsten:

• Ett starkt intresse för tvärvetenskaplig teknikutveckling, samt förmåga till nytt och kreativt tänkande.
• Omfattande erfarenhet av kromatinbiologi med publikationer med stor genomslagskraft inom området.
• Erfarenhet av transkriptionsreglering hos människor.
• Omfattande erfarenhet av CRISPR-baserade teknologier.
• Dokumenterad praktisk erfarenhet av att designa, optimera och validera genomomfattande metoder för att studera genuttryck (t.ex. ATAC-Seq, CUT&TAG, CUT&RUN, 10X scRNA-Seq, scATAC-Seq...).
• Omfattande erfarenhet av NGS-metodutveckling.
• Erfarenhet av bioinformatik och NGS-dataanalys.
• Dokumenterad meritlista för anslagsskrivning och betydande oberoende finansieringsanskaffning.
• Erfarenhet av handledning på master- och doktorandnivå.
• Goda interpersonella färdigheter och förmåga att arbeta i team.

Meriterande:

• Praktisk erfarenhet av Illumina-sekvensering.
• Erfarenhet av vetenskapskommunikation.

Vid anställningen kommer särskild vikt att läggas vid vetenskaplig kompetens av relevans för projektet och tidigare forskningserfarenhet.

Det är utifrån en sammantagen helhetsbedömning av de sökandes meriter och skicklighet som Karolinska Institutet bedömer vilken av de sökande som har de bästa förutsättningarna att bidra till en positiv utveckling av verksamheten.
Vad erbjuder vi?
En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI träffar du forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Placering: Solna

Tio skäl att välja Karolinska Institutet

http://pelechanolab.com/
Ansökan
Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska. Ansökan ska innehålla följande handlingar: Intyg om doktorsexamen, CV, meriter och beskrivning av planerad forskning som presenteras i enlighet medKarolinska Institutets meritportfölj.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.

Vid tillsvidareanställning tillämpar Karolinska Institutet 6 månaders provanställning.
Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss!