Forskningsassistent inom proteomik – Proteomanalys av bröstcancermediciners off‑target‑effekter

Om jobbet

Vill du bidra till att förbättra människors hälsa?
Karolinska Institutet, Institutionen för onkologi-patologi, Lehtiö forskargrupp

VidInstitutionen för onkologi-patologibedrivs grundläggande, translationell och klinisk forskning samt utbildningsverksamhet relaterad till cancer. Ungefär 300 personer från över 40 länder arbetar för närvarande vid institutionen. Cirka 30 forskargrupper med olika cancerforskningsprofiler är involverade och vi har runt 110 doktorander. Institutionen för onkologi-patologi ansvarar för grundutbildningskurser i patologi, onkologi och rättsmedicin för läkarstudenter, samt tumörbiologikurser för biomedicinstudenter och patologikurser för optiker.

Vill du bidra genom att koppla den senaste forskningen inom cancerproteomik till patientnytta?
Precisionsmedicin innebär att medicinsk behandling anpassas utifrån varje patients individuella egenskaper. Vi söker en engagerad forskningsassistent med intresse för precisionsmedicin baserad på masspektrometri-baserad proteomik. Arbetet kommer att omfatta både generering och analys av masspektrometribaserade proteomikdata, med målet att definiera och förstå biologin bakom läkemedel-protein-interaktioner, hur de relaterar till kliniska utfall och hur denna information kan användas för att vägleda behandlingsbeslut.

Tjänsten är placerad iforskargruppen Cancer proteomics Mass spectrometry ledd av professor Janne Lehtiö vid Science for Life Laboratory (SciLifeLab). Lehtiö-gruppen är en translationell forskargrupp som strävar efter att förbättra cancerbehandling genom multi-omics-analys av tumördata. Gruppens medlemmar kommer från olika discipliner och arbetar som ett team för att studera gener och proteiner i biologiska nätverk, förstå hur molekylära förändringar i tumörer påverkar proteomet, och upptäcka nya sjukdomsmarkörer som kan utnyttjas terapeutiskt. Forskare och ingenjörer i gruppen arbetar nära tillsammans med olika teknologier för att generera ny kunskap om sjukdomsbiologi och utveckla verktyg som kan stödja kliniskt beslutsfattande inom onkologi.

SciLifeLab är en nationell infrastruktur och forskningsmiljö inom teknikdriven livsvetenskap, och Karolinska Institutet är ett av de fyra grundande universiteten bakom SciLifeLab. Vi erbjuder ett mycket stimulerande och mångsidigt arbete i ett team av motiverade kollegor med expertis inom banbrytande teknologi.

Detta är en tidsbegränsad anställning på ca 9 månader.
Din rollVi söker en starkt motiverad forskningsassistent inom proteomik, med intresse för att besvara kliniska forskningsfrågor genom användning av proteomikmetoder. Forskningsassistenten kommer att generera masspektrometri-baserade proteomikdata från bröstcancercellinjer för att få biologisk förståelse för läkemedel-protein-interaktioner och identifiera biomarkörer i kliniska proteomik-kohorter. Tjänsten kräver gedigen expertis inom proteomik, god kommunikativ förmåga och vilja att arbeta i team. Den aktuella tjänsten erbjuder mycket goda möjligheter till innovativ forskning som kombinerar proteomik och andra omics-data, tillsammans med en engagerad grupp forskare.Vem är du?
För att vara behörig till tjänsten som forskningsassistent måste personen ha avlagt en Masterexamen i naturvetenskap eller en utländsk examen som bedöms motsvara en masterexamen. Sökande som ännu inte har slutfört sin masterexamen vid ansökningstidens slut kan också ansöka, förutsatt att alla krav för examen är uppfyllda före det (planerade) startdatumet för anställningen som forskningsassistent.

Kvalifikationer
• M.Sc. i biologi, kemi, medicin eller annat relevant område.
• Dokumenterad erfarenhet och kunskap inom provberedning och generering av masspektrometribaserade proteomikdata.
• Arbetslivserfarenhet av generering, analys, integrering och visualisering av omics-data.
• Förmåga att tolka omics-data i ett biologiskt sammanhang.
• Kunskap om statistiska metoder.
• Förståelse för cell- och molekylärbiologiska wet-lab-metoder.
• Utmärkta kommunikationsförmågor.
• Flytande engelska.

Meriterande
• Kunskap och arbetslivserfarenhet av bröstcancer och hormonreceptorpositiv bröstcancerbiologi, med fokus på postmenopausala, aromatashämmarbehandlade patienter.
• Dokumenterad erfarenhet och kunskap inom cellodling av bröstcancercellinjer och cellinjer som representerar olika typer av brösttumörceller.
• Dokumenterad erfarenhet och kunskap inom analyser för att identifiera läkemedel-protein-interaktioner, såsom Thermal Protein Profiling (TPP) eller Proteome Integral Solubility Alteration (PISA).
• Programmeringsvana i Python och/eller R eller motsvarande.

Eftersom tjänsten innebär nära samarbete med flera forskare läggs stor vikt vid personliga egenskaper såsom:
• Mycket god samarbetsförmåga.
• Utmärkta kommunikations- och analytiska färdigheter.
• Nyfikenhet och driv att lösa biologiska frågeställningar.
Vad erbjuder vi?
En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.

Placering: Science for Life Laboratory i Solna

Tio skäl att välja Karolinska Institutet
LehtiöLab

Ansökan
Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet. Ansök senast den 10 april.

Detta är en tidsbegränsad anställning på ca 9 månader högst upp till 12 månader.
Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss